Protein–RNA interactions for Protein: O43365

HOXA3, Homeobox protein Hox-A3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 443 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA3O43365 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
HOXA3O43365 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
HOXA3O43365 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
HOXA3O43365 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
HOXA3O43365 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HOXA3O43365 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HOXA3O43365 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
HOXA3O43365 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
HOXA3O43365 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HOXA3O43365 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HOXA3O43365 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
HOXA3O43365 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
HOXA3O43365 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HOXA3O43365 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
HOXA3O43365 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
HOXA3O43365 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
HOXA3O43365 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
HOXA3O43365 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
HOXA3O43365 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HOXA3O43365 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
HOXA3O43365 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HOXA3O43365 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HOXA3O43365 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HOXA3O43365 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HOXA3O43365 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
HOXA3O43365 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HOXA3O43365 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HOXA3O43365 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HOXA3O43365 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
HOXA3O43365 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HOXA3O43365 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HOXA3O43365 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
HOXA3O43365 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
HOXA3O43365 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
HOXA3O43365 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
HOXA3O43365 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
HOXA3O43365 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
HOXA3O43365 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
HOXA3O43365 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
HOXA3O43365 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HOXA3O43365 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
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HOXA3O43365 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
HOXA3O43365 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HOXA3O43365 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HOXA3O43365 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
HOXA3O43365 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HOXA3O43365 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HOXA3O43365 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
HOXA3O43365 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
HOXA3O43365 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
HOXA3O43365 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HOXA3O43365 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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HOXA3O43365 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HOXA3O43365 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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HOXA3O43365 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HOXA3O43365 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HOXA3O43365 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HOXA3O43365 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
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HOXA3O43365 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HOXA3O43365 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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HOXA3O43365 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
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HOXA3O43365 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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HOXA3O43365 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
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HOXA3O43365 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HOXA3O43365 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
HOXA3O43365 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HOXA3O43365 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
HOXA3O43365 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HOXA3O43365 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HOXA3O43365 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HOXA3O43365 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HOXA3O43365 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HOXA3O43365 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HOXA3O43365 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HOXA3O43365 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HOXA3O43365 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HOXA3O43365 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HOXA3O43365 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HOXA3O43365 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HOXA3O43365 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HOXA3O43365 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
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