Protein–RNA interactions for Protein: O15541

RNF113A, RING finger protein 113A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 343 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF113AO15541 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RNF113AO15541 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RNF113AO15541 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RNF113AO15541 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RNF113AO15541 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RNF113AO15541 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RNF113AO15541 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RNF113AO15541 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RNF113AO15541 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RNF113AO15541 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RNF113AO15541 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RNF113AO15541 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
RNF113AO15541 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RNF113AO15541 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RNF113AO15541 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RNF113AO15541 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RNF113AO15541 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RNF113AO15541 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RNF113AO15541 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
RNF113AO15541 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RNF113AO15541 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
RNF113AO15541 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RNF113AO15541 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RNF113AO15541 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RNF113AO15541 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RNF113AO15541 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
RNF113AO15541 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RNF113AO15541 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RNF113AO15541 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RNF113AO15541 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RNF113AO15541 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RNF113AO15541 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RNF113AO15541 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RNF113AO15541 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RNF113AO15541 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RNF113AO15541 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RNF113AO15541 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
RNF113AO15541 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RNF113AO15541 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RNF113AO15541 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RNF113AO15541 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RNF113AO15541 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RNF113AO15541 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RNF113AO15541 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RNF113AO15541 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RNF113AO15541 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RNF113AO15541 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RNF113AO15541 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RNF113AO15541 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RNF113AO15541 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RNF113AO15541 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RNF113AO15541 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RNF113AO15541 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RNF113AO15541 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RNF113AO15541 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RNF113AO15541 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RNF113AO15541 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RNF113AO15541 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RNF113AO15541 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RNF113AO15541 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RNF113AO15541 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RNF113AO15541 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RNF113AO15541 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RNF113AO15541 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RNF113AO15541 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RNF113AO15541 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RNF113AO15541 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RNF113AO15541 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RNF113AO15541 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RNF113AO15541 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RNF113AO15541 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RNF113AO15541 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RNF113AO15541 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RNF113AO15541 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RNF113AO15541 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RNF113AO15541 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RNF113AO15541 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RNF113AO15541 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RNF113AO15541 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RNF113AO15541 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RNF113AO15541 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RNF113AO15541 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RNF113AO15541 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
RNF113AO15541 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RNF113AO15541 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RNF113AO15541 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RNF113AO15541 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RNF113AO15541 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RNF113AO15541 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
RNF113AO15541 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RNF113AO15541 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RNF113AO15541 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RNF113AO15541 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RNF113AO15541 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RNF113AO15541 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RNF113AO15541 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RNF113AO15541 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RNF113AO15541 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RNF113AO15541 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RNF113AO15541 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
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