Protein–RNA interactions for Protein: O15524

SOCS1, Suppressor of cytokine signaling 1, humanhuman

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOCS1O15524 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SOCS1O15524 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SOCS1O15524 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SOCS1O15524 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SOCS1O15524 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SOCS1O15524 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SOCS1O15524 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SOCS1O15524 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SOCS1O15524 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SOCS1O15524 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SOCS1O15524 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SOCS1O15524 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SOCS1O15524 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SOCS1O15524 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SOCS1O15524 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SOCS1O15524 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SOCS1O15524 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SOCS1O15524 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SOCS1O15524 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SOCS1O15524 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SOCS1O15524 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SOCS1O15524 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SOCS1O15524 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SOCS1O15524 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SOCS1O15524 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SOCS1O15524 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SOCS1O15524 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SOCS1O15524 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SOCS1O15524 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SOCS1O15524 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SOCS1O15524 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SOCS1O15524 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SOCS1O15524 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SOCS1O15524 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SOCS1O15524 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SOCS1O15524 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SOCS1O15524 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SOCS1O15524 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SOCS1O15524 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SOCS1O15524 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SOCS1O15524 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SOCS1O15524 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SOCS1O15524 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SOCS1O15524 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SOCS1O15524 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SOCS1O15524 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SOCS1O15524 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SOCS1O15524 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SOCS1O15524 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SOCS1O15524 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SOCS1O15524 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SOCS1O15524 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SOCS1O15524 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SOCS1O15524 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SOCS1O15524 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SOCS1O15524 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SOCS1O15524 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SOCS1O15524 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SOCS1O15524 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SOCS1O15524 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SOCS1O15524 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SOCS1O15524 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SOCS1O15524 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SOCS1O15524 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SOCS1O15524 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SOCS1O15524 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SOCS1O15524 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SOCS1O15524 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SOCS1O15524 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SOCS1O15524 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SOCS1O15524 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SOCS1O15524 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SOCS1O15524 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SOCS1O15524 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SOCS1O15524 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SOCS1O15524 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SOCS1O15524 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SOCS1O15524 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SOCS1O15524 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SOCS1O15524 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SOCS1O15524 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SOCS1O15524 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SOCS1O15524 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SOCS1O15524 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SOCS1O15524 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SOCS1O15524 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SOCS1O15524 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SOCS1O15524 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SOCS1O15524 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SOCS1O15524 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SOCS1O15524 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SOCS1O15524 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SOCS1O15524 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SOCS1O15524 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SOCS1O15524 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SOCS1O15524 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SOCS1O15524 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SOCS1O15524 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SOCS1O15524 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SOCS1O15524 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms