Protein–RNA interactions for Protein: O15054

KDM6B, Lysine-specific demethylase 6B, humanhuman

Predictions only

Length 1,643 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM6BO15054 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
KDM6BO15054 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
KDM6BO15054 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
KDM6BO15054 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
KDM6BO15054 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
KDM6BO15054 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
KDM6BO15054 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
KDM6BO15054 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
KDM6BO15054 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC28.04■■■□□ 2.08
KDM6BO15054 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
KDM6BO15054 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
KDM6BO15054 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
KDM6BO15054 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
KDM6BO15054 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
KDM6BO15054 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
KDM6BO15054 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
KDM6BO15054 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
KDM6BO15054 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
KDM6BO15054 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
KDM6BO15054 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
KDM6BO15054 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
KDM6BO15054 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC28.03■■■□□ 2.08
KDM6BO15054 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
KDM6BO15054 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
KDM6BO15054 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
KDM6BO15054 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
KDM6BO15054 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
KDM6BO15054 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
KDM6BO15054 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
KDM6BO15054 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
KDM6BO15054 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
KDM6BO15054 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
KDM6BO15054 CHMP2B-205ENST00000494980 1175 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
KDM6BO15054 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
KDM6BO15054 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
KDM6BO15054 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
KDM6BO15054 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC28.02■■■□□ 2.08
KDM6BO15054 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
KDM6BO15054 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
KDM6BO15054 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
KDM6BO15054 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
KDM6BO15054 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
KDM6BO15054 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
KDM6BO15054 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
KDM6BO15054 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
KDM6BO15054 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
KDM6BO15054 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
KDM6BO15054 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
KDM6BO15054 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
KDM6BO15054 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
KDM6BO15054 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
KDM6BO15054 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
KDM6BO15054 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
KDM6BO15054 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
KDM6BO15054 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
KDM6BO15054 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC28.01■■■□□ 2.08
KDM6BO15054 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC28.01■■■□□ 2.08
KDM6BO15054 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
KDM6BO15054 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC28.01■■■□□ 2.07
KDM6BO15054 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
KDM6BO15054 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
KDM6BO15054 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC28.01■■■□□ 2.07
KDM6BO15054 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
KDM6BO15054 AC082651.1-201ENST00000478468 832 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
KDM6BO15054 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
KDM6BO15054 STMN4-207ENST00000523048 1224 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
KDM6BO15054 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
KDM6BO15054 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
KDM6BO15054 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
KDM6BO15054 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
KDM6BO15054 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
KDM6BO15054 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC28.01■■■□□ 2.07
KDM6BO15054 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
KDM6BO15054 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
KDM6BO15054 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
KDM6BO15054 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
KDM6BO15054 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
KDM6BO15054 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
KDM6BO15054 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
KDM6BO15054 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
KDM6BO15054 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
KDM6BO15054 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
KDM6BO15054 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
KDM6BO15054 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
KDM6BO15054 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
KDM6BO15054 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
KDM6BO15054 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
KDM6BO15054 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
KDM6BO15054 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
KDM6BO15054 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
KDM6BO15054 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
KDM6BO15054 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC28■■■□□ 2.07
KDM6BO15054 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
KDM6BO15054 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
KDM6BO15054 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
KDM6BO15054 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
KDM6BO15054 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
KDM6BO15054 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC28■■■□□ 2.07
KDM6BO15054 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
KDM6BO15054 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.9 ms