Protein–RNA interactions for Protein: O14503

BHLHE40, Class E basic helix-loop-helix protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHE40O14503 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BHLHE40O14503 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BHLHE40O14503 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
BHLHE40O14503 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
BHLHE40O14503 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BHLHE40O14503 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
BHLHE40O14503 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
BHLHE40O14503 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
BHLHE40O14503 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BHLHE40O14503 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
BHLHE40O14503 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
BHLHE40O14503 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
BHLHE40O14503 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
BHLHE40O14503 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
BHLHE40O14503 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
BHLHE40O14503 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
BHLHE40O14503 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
BHLHE40O14503 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BHLHE40O14503 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BHLHE40O14503 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BHLHE40O14503 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
BHLHE40O14503 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BHLHE40O14503 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BHLHE40O14503 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
BHLHE40O14503 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
BHLHE40O14503 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BHLHE40O14503 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BHLHE40O14503 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
BHLHE40O14503 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BHLHE40O14503 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
BHLHE40O14503 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BHLHE40O14503 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BHLHE40O14503 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
BHLHE40O14503 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BHLHE40O14503 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BHLHE40O14503 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
BHLHE40O14503 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
BHLHE40O14503 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BHLHE40O14503 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
BHLHE40O14503 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
BHLHE40O14503 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BHLHE40O14503 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BHLHE40O14503 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
BHLHE40O14503 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BHLHE40O14503 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
BHLHE40O14503 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BHLHE40O14503 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BHLHE40O14503 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BHLHE40O14503 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
BHLHE40O14503 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BHLHE40O14503 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
BHLHE40O14503 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BHLHE40O14503 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BHLHE40O14503 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
BHLHE40O14503 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
BHLHE40O14503 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
BHLHE40O14503 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
BHLHE40O14503 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
BHLHE40O14503 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
BHLHE40O14503 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BHLHE40O14503 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
BHLHE40O14503 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
BHLHE40O14503 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
BHLHE40O14503 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
BHLHE40O14503 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
BHLHE40O14503 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BHLHE40O14503 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
BHLHE40O14503 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
BHLHE40O14503 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BHLHE40O14503 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BHLHE40O14503 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BHLHE40O14503 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
BHLHE40O14503 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BHLHE40O14503 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BHLHE40O14503 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BHLHE40O14503 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
BHLHE40O14503 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
BHLHE40O14503 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
BHLHE40O14503 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BHLHE40O14503 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BHLHE40O14503 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
BHLHE40O14503 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BHLHE40O14503 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
BHLHE40O14503 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BHLHE40O14503 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BHLHE40O14503 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BHLHE40O14503 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
BHLHE40O14503 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BHLHE40O14503 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BHLHE40O14503 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BHLHE40O14503 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
BHLHE40O14503 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BHLHE40O14503 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
BHLHE40O14503 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BHLHE40O14503 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
BHLHE40O14503 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
BHLHE40O14503 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
BHLHE40O14503 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
BHLHE40O14503 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
BHLHE40O14503 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms