Protein–RNA interactions for Protein: F8W1W9

NPIPB9, Nuclear pore complex-interacting protein family member B9, humanhuman

Predictions only

Length 429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPIPB9F8W1W9 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NPIPB9F8W1W9 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NPIPB9F8W1W9 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NPIPB9F8W1W9 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NPIPB9F8W1W9 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
NPIPB9F8W1W9 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NPIPB9F8W1W9 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NPIPB9F8W1W9 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NPIPB9F8W1W9 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NPIPB9F8W1W9 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NPIPB9F8W1W9 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
NPIPB9F8W1W9 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NPIPB9F8W1W9 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NPIPB9F8W1W9 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NPIPB9F8W1W9 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NPIPB9F8W1W9 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NPIPB9F8W1W9 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NPIPB9F8W1W9 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NPIPB9F8W1W9 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NPIPB9F8W1W9 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NPIPB9F8W1W9 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NPIPB9F8W1W9 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NPIPB9F8W1W9 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NPIPB9F8W1W9 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NPIPB9F8W1W9 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NPIPB9F8W1W9 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NPIPB9F8W1W9 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NPIPB9F8W1W9 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NPIPB9F8W1W9 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NPIPB9F8W1W9 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NPIPB9F8W1W9 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NPIPB9F8W1W9 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NPIPB9F8W1W9 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NPIPB9F8W1W9 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NPIPB9F8W1W9 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NPIPB9F8W1W9 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NPIPB9F8W1W9 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NPIPB9F8W1W9 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NPIPB9F8W1W9 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NPIPB9F8W1W9 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NPIPB9F8W1W9 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NPIPB9F8W1W9 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NPIPB9F8W1W9 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
NPIPB9F8W1W9 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NPIPB9F8W1W9 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NPIPB9F8W1W9 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NPIPB9F8W1W9 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NPIPB9F8W1W9 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NPIPB9F8W1W9 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NPIPB9F8W1W9 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
NPIPB9F8W1W9 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NPIPB9F8W1W9 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NPIPB9F8W1W9 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NPIPB9F8W1W9 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NPIPB9F8W1W9 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NPIPB9F8W1W9 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NPIPB9F8W1W9 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NPIPB9F8W1W9 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NPIPB9F8W1W9 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NPIPB9F8W1W9 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NPIPB9F8W1W9 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NPIPB9F8W1W9 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NPIPB9F8W1W9 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NPIPB9F8W1W9 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NPIPB9F8W1W9 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NPIPB9F8W1W9 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NPIPB9F8W1W9 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NPIPB9F8W1W9 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NPIPB9F8W1W9 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NPIPB9F8W1W9 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NPIPB9F8W1W9 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NPIPB9F8W1W9 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NPIPB9F8W1W9 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NPIPB9F8W1W9 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NPIPB9F8W1W9 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NPIPB9F8W1W9 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NPIPB9F8W1W9 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NPIPB9F8W1W9 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NPIPB9F8W1W9 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NPIPB9F8W1W9 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NPIPB9F8W1W9 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
NPIPB9F8W1W9 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NPIPB9F8W1W9 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NPIPB9F8W1W9 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NPIPB9F8W1W9 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NPIPB9F8W1W9 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NPIPB9F8W1W9 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NPIPB9F8W1W9 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NPIPB9F8W1W9 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NPIPB9F8W1W9 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
NPIPB9F8W1W9 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NPIPB9F8W1W9 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NPIPB9F8W1W9 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NPIPB9F8W1W9 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NPIPB9F8W1W9 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
NPIPB9F8W1W9 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NPIPB9F8W1W9 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
NPIPB9F8W1W9 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NPIPB9F8W1W9 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NPIPB9F8W1W9 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms