Protein–RNA interactions for Protein: E9PGA6

C1QTNF3-AMACR, C1QTNF3-AMACR readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.7 ms