Protein–RNA interactions for Protein: C9JLJ4

USP17L13, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L13C9JLJ4 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
USP17L13C9JLJ4 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
USP17L13C9JLJ4 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
USP17L13C9JLJ4 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
USP17L13C9JLJ4 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
USP17L13C9JLJ4 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
USP17L13C9JLJ4 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
USP17L13C9JLJ4 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
USP17L13C9JLJ4 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
USP17L13C9JLJ4 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
USP17L13C9JLJ4 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
USP17L13C9JLJ4 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
USP17L13C9JLJ4 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
USP17L13C9JLJ4 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC21.13■□□□□ 0.97
USP17L13C9JLJ4 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
USP17L13C9JLJ4 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
USP17L13C9JLJ4 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
USP17L13C9JLJ4 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
USP17L13C9JLJ4 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
USP17L13C9JLJ4 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
USP17L13C9JLJ4 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
USP17L13C9JLJ4 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
USP17L13C9JLJ4 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
USP17L13C9JLJ4 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
USP17L13C9JLJ4 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
USP17L13C9JLJ4 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
USP17L13C9JLJ4 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
USP17L13C9JLJ4 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
USP17L13C9JLJ4 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
USP17L13C9JLJ4 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
USP17L13C9JLJ4 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
USP17L13C9JLJ4 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
USP17L13C9JLJ4 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
USP17L13C9JLJ4 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
USP17L13C9JLJ4 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
USP17L13C9JLJ4 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
USP17L13C9JLJ4 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
USP17L13C9JLJ4 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC21.12■□□□□ 0.97
USP17L13C9JLJ4 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
USP17L13C9JLJ4 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
USP17L13C9JLJ4 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
USP17L13C9JLJ4 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
USP17L13C9JLJ4 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
USP17L13C9JLJ4 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
USP17L13C9JLJ4 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
USP17L13C9JLJ4 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
USP17L13C9JLJ4 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
USP17L13C9JLJ4 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
USP17L13C9JLJ4 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
USP17L13C9JLJ4 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
USP17L13C9JLJ4 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
USP17L13C9JLJ4 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
USP17L13C9JLJ4 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
USP17L13C9JLJ4 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
USP17L13C9JLJ4 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
USP17L13C9JLJ4 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
USP17L13C9JLJ4 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
USP17L13C9JLJ4 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
USP17L13C9JLJ4 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
USP17L13C9JLJ4 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
USP17L13C9JLJ4 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
USP17L13C9JLJ4 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
USP17L13C9JLJ4 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
USP17L13C9JLJ4 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
USP17L13C9JLJ4 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
USP17L13C9JLJ4 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
USP17L13C9JLJ4 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
USP17L13C9JLJ4 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
USP17L13C9JLJ4 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
USP17L13C9JLJ4 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
USP17L13C9JLJ4 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
USP17L13C9JLJ4 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
USP17L13C9JLJ4 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
USP17L13C9JLJ4 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
USP17L13C9JLJ4 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
USP17L13C9JLJ4 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
USP17L13C9JLJ4 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
USP17L13C9JLJ4 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
USP17L13C9JLJ4 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
USP17L13C9JLJ4 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
USP17L13C9JLJ4 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
USP17L13C9JLJ4 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
USP17L13C9JLJ4 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
USP17L13C9JLJ4 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
USP17L13C9JLJ4 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
USP17L13C9JLJ4 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
USP17L13C9JLJ4 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
USP17L13C9JLJ4 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
USP17L13C9JLJ4 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
USP17L13C9JLJ4 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
USP17L13C9JLJ4 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
USP17L13C9JLJ4 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
USP17L13C9JLJ4 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
USP17L13C9JLJ4 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
USP17L13C9JLJ4 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
USP17L13C9JLJ4 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
USP17L13C9JLJ4 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
USP17L13C9JLJ4 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
USP17L13C9JLJ4 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
USP17L13C9JLJ4 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms