Protein–RNA interactions for Protein: A7XYQ1

SOBP, Sine oculis-binding protein homolog, humanhuman

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Length 873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOBPA7XYQ1 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SOBPA7XYQ1 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SOBPA7XYQ1 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SOBPA7XYQ1 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SOBPA7XYQ1 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SOBPA7XYQ1 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SOBPA7XYQ1 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SOBPA7XYQ1 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SOBPA7XYQ1 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SOBPA7XYQ1 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SOBPA7XYQ1 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SOBPA7XYQ1 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SOBPA7XYQ1 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SOBPA7XYQ1 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SOBPA7XYQ1 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SOBPA7XYQ1 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SOBPA7XYQ1 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SOBPA7XYQ1 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SOBPA7XYQ1 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SOBPA7XYQ1 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SOBPA7XYQ1 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SOBPA7XYQ1 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SOBPA7XYQ1 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SOBPA7XYQ1 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SOBPA7XYQ1 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
SOBPA7XYQ1 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SOBPA7XYQ1 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SOBPA7XYQ1 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SOBPA7XYQ1 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SOBPA7XYQ1 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SOBPA7XYQ1 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SOBPA7XYQ1 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SOBPA7XYQ1 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
SOBPA7XYQ1 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SOBPA7XYQ1 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SOBPA7XYQ1 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SOBPA7XYQ1 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SOBPA7XYQ1 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SOBPA7XYQ1 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SOBPA7XYQ1 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SOBPA7XYQ1 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SOBPA7XYQ1 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SOBPA7XYQ1 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SOBPA7XYQ1 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SOBPA7XYQ1 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SOBPA7XYQ1 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
SOBPA7XYQ1 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SOBPA7XYQ1 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SOBPA7XYQ1 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SOBPA7XYQ1 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SOBPA7XYQ1 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SOBPA7XYQ1 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SOBPA7XYQ1 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SOBPA7XYQ1 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
SOBPA7XYQ1 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
SOBPA7XYQ1 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
SOBPA7XYQ1 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SOBPA7XYQ1 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SOBPA7XYQ1 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SOBPA7XYQ1 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SOBPA7XYQ1 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SOBPA7XYQ1 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SOBPA7XYQ1 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SOBPA7XYQ1 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SOBPA7XYQ1 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SOBPA7XYQ1 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
SOBPA7XYQ1 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
SOBPA7XYQ1 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
SOBPA7XYQ1 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
SOBPA7XYQ1 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
SOBPA7XYQ1 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
SOBPA7XYQ1 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
SOBPA7XYQ1 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
SOBPA7XYQ1 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
SOBPA7XYQ1 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SOBPA7XYQ1 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SOBPA7XYQ1 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SOBPA7XYQ1 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
SOBPA7XYQ1 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SOBPA7XYQ1 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SOBPA7XYQ1 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SOBPA7XYQ1 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
SOBPA7XYQ1 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SOBPA7XYQ1 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SOBPA7XYQ1 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SOBPA7XYQ1 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SOBPA7XYQ1 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SOBPA7XYQ1 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SOBPA7XYQ1 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SOBPA7XYQ1 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SOBPA7XYQ1 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SOBPA7XYQ1 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
SOBPA7XYQ1 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SOBPA7XYQ1 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SOBPA7XYQ1 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SOBPA7XYQ1 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SOBPA7XYQ1 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SOBPA7XYQ1 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SOBPA7XYQ1 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SOBPA7XYQ1 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
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