Protein–RNA interactions for Protein: A7E2F4

GOLGA8A, Golgin subfamily A member 8A, humanhuman

Predictions only

Length 631 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA8AA7E2F4 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GOLGA8AA7E2F4 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GOLGA8AA7E2F4 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GOLGA8AA7E2F4 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GOLGA8AA7E2F4 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GOLGA8AA7E2F4 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC21.3■■□□□ 1
GOLGA8AA7E2F4 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GOLGA8AA7E2F4 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
GOLGA8AA7E2F4 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GOLGA8AA7E2F4 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
GOLGA8AA7E2F4 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GOLGA8AA7E2F4 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GOLGA8AA7E2F4 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GOLGA8AA7E2F4 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GOLGA8AA7E2F4 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GOLGA8AA7E2F4 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GOLGA8AA7E2F4 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC21.29■■□□□ 1
GOLGA8AA7E2F4 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
GOLGA8AA7E2F4 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GOLGA8AA7E2F4 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GOLGA8AA7E2F4 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
GOLGA8AA7E2F4 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC21.29■■□□□ 1
GOLGA8AA7E2F4 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
GOLGA8AA7E2F4 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
GOLGA8AA7E2F4 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
GOLGA8AA7E2F4 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GOLGA8AA7E2F4 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC21.29■■□□□ 1
GOLGA8AA7E2F4 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
GOLGA8AA7E2F4 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
GOLGA8AA7E2F4 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
GOLGA8AA7E2F4 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GOLGA8AA7E2F4 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GOLGA8AA7E2F4 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GOLGA8AA7E2F4 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
GOLGA8AA7E2F4 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GOLGA8AA7E2F4 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
GOLGA8AA7E2F4 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
GOLGA8AA7E2F4 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GOLGA8AA7E2F4 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
GOLGA8AA7E2F4 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GOLGA8AA7E2F4 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GOLGA8AA7E2F4 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GOLGA8AA7E2F4 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GOLGA8AA7E2F4 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GOLGA8AA7E2F4 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GOLGA8AA7E2F4 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GOLGA8AA7E2F4 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GOLGA8AA7E2F4 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
GOLGA8AA7E2F4 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GOLGA8AA7E2F4 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
GOLGA8AA7E2F4 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GOLGA8AA7E2F4 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
GOLGA8AA7E2F4 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
GOLGA8AA7E2F4 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC21.28■■□□□ 1
GOLGA8AA7E2F4 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
GOLGA8AA7E2F4 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GOLGA8AA7E2F4 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
GOLGA8AA7E2F4 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GOLGA8AA7E2F4 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GOLGA8AA7E2F4 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GOLGA8AA7E2F4 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GOLGA8AA7E2F4 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
GOLGA8AA7E2F4 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
GOLGA8AA7E2F4 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
GOLGA8AA7E2F4 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
GOLGA8AA7E2F4 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GOLGA8AA7E2F4 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GOLGA8AA7E2F4 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GOLGA8AA7E2F4 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
GOLGA8AA7E2F4 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GOLGA8AA7E2F4 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GOLGA8AA7E2F4 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
GOLGA8AA7E2F4 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
GOLGA8AA7E2F4 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GOLGA8AA7E2F4 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.27■■□□□ 1
GOLGA8AA7E2F4 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GOLGA8AA7E2F4 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC21.27■■□□□ 1
GOLGA8AA7E2F4 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
GOLGA8AA7E2F4 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
GOLGA8AA7E2F4 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
GOLGA8AA7E2F4 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC21.27■■□□□ 1
GOLGA8AA7E2F4 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
GOLGA8AA7E2F4 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
GOLGA8AA7E2F4 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
GOLGA8AA7E2F4 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
GOLGA8AA7E2F4 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
GOLGA8AA7E2F4 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
GOLGA8AA7E2F4 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
GOLGA8AA7E2F4 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GOLGA8AA7E2F4 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GOLGA8AA7E2F4 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GOLGA8AA7E2F4 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GOLGA8AA7E2F4 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GOLGA8AA7E2F4 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GOLGA8AA7E2F4 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GOLGA8AA7E2F4 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GOLGA8AA7E2F4 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GOLGA8AA7E2F4 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GOLGA8AA7E2F4 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GOLGA8AA7E2F4 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms