Protein–RNA interactions for Protein: A6NFY4

NEMP2, Nuclear envelope integral membrane protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEMP2A6NFY4 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NEMP2A6NFY4 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
NEMP2A6NFY4 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NEMP2A6NFY4 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
NEMP2A6NFY4 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NEMP2A6NFY4 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
NEMP2A6NFY4 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NEMP2A6NFY4 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NEMP2A6NFY4 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NEMP2A6NFY4 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NEMP2A6NFY4 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NEMP2A6NFY4 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NEMP2A6NFY4 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NEMP2A6NFY4 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NEMP2A6NFY4 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NEMP2A6NFY4 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
NEMP2A6NFY4 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NEMP2A6NFY4 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NEMP2A6NFY4 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
NEMP2A6NFY4 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NEMP2A6NFY4 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NEMP2A6NFY4 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NEMP2A6NFY4 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NEMP2A6NFY4 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NEMP2A6NFY4 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NEMP2A6NFY4 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NEMP2A6NFY4 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NEMP2A6NFY4 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NEMP2A6NFY4 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NEMP2A6NFY4 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
NEMP2A6NFY4 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NEMP2A6NFY4 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NEMP2A6NFY4 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NEMP2A6NFY4 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NEMP2A6NFY4 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NEMP2A6NFY4 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NEMP2A6NFY4 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NEMP2A6NFY4 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NEMP2A6NFY4 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NEMP2A6NFY4 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NEMP2A6NFY4 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NEMP2A6NFY4 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NEMP2A6NFY4 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NEMP2A6NFY4 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NEMP2A6NFY4 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NEMP2A6NFY4 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NEMP2A6NFY4 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NEMP2A6NFY4 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NEMP2A6NFY4 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NEMP2A6NFY4 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NEMP2A6NFY4 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NEMP2A6NFY4 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NEMP2A6NFY4 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NEMP2A6NFY4 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NEMP2A6NFY4 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NEMP2A6NFY4 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NEMP2A6NFY4 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NEMP2A6NFY4 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NEMP2A6NFY4 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NEMP2A6NFY4 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NEMP2A6NFY4 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NEMP2A6NFY4 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NEMP2A6NFY4 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NEMP2A6NFY4 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
NEMP2A6NFY4 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
NEMP2A6NFY4 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NEMP2A6NFY4 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NEMP2A6NFY4 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NEMP2A6NFY4 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NEMP2A6NFY4 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NEMP2A6NFY4 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NEMP2A6NFY4 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NEMP2A6NFY4 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NEMP2A6NFY4 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NEMP2A6NFY4 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
NEMP2A6NFY4 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NEMP2A6NFY4 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NEMP2A6NFY4 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NEMP2A6NFY4 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NEMP2A6NFY4 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NEMP2A6NFY4 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NEMP2A6NFY4 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NEMP2A6NFY4 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NEMP2A6NFY4 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NEMP2A6NFY4 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NEMP2A6NFY4 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NEMP2A6NFY4 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NEMP2A6NFY4 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NEMP2A6NFY4 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NEMP2A6NFY4 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NEMP2A6NFY4 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NEMP2A6NFY4 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NEMP2A6NFY4 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NEMP2A6NFY4 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NEMP2A6NFY4 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NEMP2A6NFY4 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NEMP2A6NFY4 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NEMP2A6NFY4 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NEMP2A6NFY4 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NEMP2A6NFY4 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms