Protein–RNA interactions for Protein: A3QJZ6

PRAMEF22, PRAME family member 22, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF22A3QJZ6 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PRAMEF22A3QJZ6 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PRAMEF22A3QJZ6 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
PRAMEF22A3QJZ6 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PRAMEF22A3QJZ6 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PRAMEF22A3QJZ6 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PRAMEF22A3QJZ6 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PRAMEF22A3QJZ6 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PRAMEF22A3QJZ6 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PRAMEF22A3QJZ6 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PRAMEF22A3QJZ6 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PRAMEF22A3QJZ6 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PRAMEF22A3QJZ6 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PRAMEF22A3QJZ6 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PRAMEF22A3QJZ6 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PRAMEF22A3QJZ6 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PRAMEF22A3QJZ6 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PRAMEF22A3QJZ6 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PRAMEF22A3QJZ6 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PRAMEF22A3QJZ6 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PRAMEF22A3QJZ6 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PRAMEF22A3QJZ6 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
PRAMEF22A3QJZ6 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PRAMEF22A3QJZ6 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PRAMEF22A3QJZ6 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PRAMEF22A3QJZ6 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PRAMEF22A3QJZ6 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PRAMEF22A3QJZ6 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PRAMEF22A3QJZ6 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PRAMEF22A3QJZ6 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PRAMEF22A3QJZ6 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PRAMEF22A3QJZ6 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PRAMEF22A3QJZ6 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PRAMEF22A3QJZ6 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PRAMEF22A3QJZ6 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PRAMEF22A3QJZ6 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PRAMEF22A3QJZ6 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PRAMEF22A3QJZ6 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PRAMEF22A3QJZ6 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PRAMEF22A3QJZ6 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PRAMEF22A3QJZ6 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PRAMEF22A3QJZ6 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
PRAMEF22A3QJZ6 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PRAMEF22A3QJZ6 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PRAMEF22A3QJZ6 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
PRAMEF22A3QJZ6 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PRAMEF22A3QJZ6 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PRAMEF22A3QJZ6 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PRAMEF22A3QJZ6 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PRAMEF22A3QJZ6 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRAMEF22A3QJZ6 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRAMEF22A3QJZ6 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRAMEF22A3QJZ6 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRAMEF22A3QJZ6 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRAMEF22A3QJZ6 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRAMEF22A3QJZ6 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRAMEF22A3QJZ6 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRAMEF22A3QJZ6 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRAMEF22A3QJZ6 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRAMEF22A3QJZ6 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRAMEF22A3QJZ6 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRAMEF22A3QJZ6 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRAMEF22A3QJZ6 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
PRAMEF22A3QJZ6 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRAMEF22A3QJZ6 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRAMEF22A3QJZ6 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRAMEF22A3QJZ6 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRAMEF22A3QJZ6 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRAMEF22A3QJZ6 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRAMEF22A3QJZ6 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRAMEF22A3QJZ6 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
PRAMEF22A3QJZ6 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRAMEF22A3QJZ6 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRAMEF22A3QJZ6 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRAMEF22A3QJZ6 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRAMEF22A3QJZ6 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRAMEF22A3QJZ6 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRAMEF22A3QJZ6 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRAMEF22A3QJZ6 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRAMEF22A3QJZ6 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRAMEF22A3QJZ6 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRAMEF22A3QJZ6 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRAMEF22A3QJZ6 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRAMEF22A3QJZ6 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRAMEF22A3QJZ6 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRAMEF22A3QJZ6 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRAMEF22A3QJZ6 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRAMEF22A3QJZ6 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRAMEF22A3QJZ6 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRAMEF22A3QJZ6 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
PRAMEF22A3QJZ6 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRAMEF22A3QJZ6 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRAMEF22A3QJZ6 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRAMEF22A3QJZ6 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRAMEF22A3QJZ6 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRAMEF22A3QJZ6 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRAMEF22A3QJZ6 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRAMEF22A3QJZ6 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRAMEF22A3QJZ6 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRAMEF22A3QJZ6 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms