Protein–RNA interactions for Protein: A2IDD5

CCDC78, Coiled-coil domain-containing protein 78, humanhuman

Predictions only

Length 438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC78A2IDD5 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC78A2IDD5 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC78A2IDD5 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC78A2IDD5 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC78A2IDD5 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC78A2IDD5 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC78A2IDD5 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC78A2IDD5 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC78A2IDD5 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC78A2IDD5 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC78A2IDD5 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC78A2IDD5 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC78A2IDD5 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC78A2IDD5 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC78A2IDD5 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC78A2IDD5 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC78A2IDD5 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC78A2IDD5 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC78A2IDD5 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC78A2IDD5 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC78A2IDD5 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC78A2IDD5 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC78A2IDD5 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC78A2IDD5 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC78A2IDD5 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC78A2IDD5 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC78A2IDD5 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC78A2IDD5 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC78A2IDD5 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC78A2IDD5 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC78A2IDD5 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC78A2IDD5 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC78A2IDD5 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC78A2IDD5 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC78A2IDD5 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC78A2IDD5 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC78A2IDD5 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC78A2IDD5 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC78A2IDD5 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC78A2IDD5 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC78A2IDD5 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC78A2IDD5 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC78A2IDD5 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC78A2IDD5 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC78A2IDD5 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC78A2IDD5 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC78A2IDD5 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC78A2IDD5 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC78A2IDD5 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC78A2IDD5 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC78A2IDD5 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC78A2IDD5 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC78A2IDD5 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC78A2IDD5 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC78A2IDD5 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC78A2IDD5 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC78A2IDD5 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC78A2IDD5 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC78A2IDD5 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC78A2IDD5 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC78A2IDD5 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC78A2IDD5 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC78A2IDD5 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC78A2IDD5 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC78A2IDD5 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC78A2IDD5 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC78A2IDD5 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC78A2IDD5 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC78A2IDD5 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC78A2IDD5 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC78A2IDD5 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC78A2IDD5 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC78A2IDD5 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC78A2IDD5 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC78A2IDD5 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC78A2IDD5 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC78A2IDD5 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC78A2IDD5 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC78A2IDD5 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC78A2IDD5 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC78A2IDD5 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC78A2IDD5 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC78A2IDD5 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC78A2IDD5 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC78A2IDD5 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC78A2IDD5 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC78A2IDD5 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC78A2IDD5 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC78A2IDD5 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC78A2IDD5 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC78A2IDD5 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC78A2IDD5 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC78A2IDD5 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC78A2IDD5 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC78A2IDD5 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC78A2IDD5 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC78A2IDD5 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC78A2IDD5 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC78A2IDD5 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC78A2IDD5 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms