Protein–RNA interactions for Protein: A0A075B6S5

IGKV1-27, Immunoglobulin kappa variable 1-27, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGKV1-27A0A075B6S5 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
IGKV1-27A0A075B6S5 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
IGKV1-27A0A075B6S5 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
IGKV1-27A0A075B6S5 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
IGKV1-27A0A075B6S5 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
IGKV1-27A0A075B6S5 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
IGKV1-27A0A075B6S5 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
IGKV1-27A0A075B6S5 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
IGKV1-27A0A075B6S5 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
IGKV1-27A0A075B6S5 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
IGKV1-27A0A075B6S5 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
IGKV1-27A0A075B6S5 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
IGKV1-27A0A075B6S5 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
IGKV1-27A0A075B6S5 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
IGKV1-27A0A075B6S5 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
IGKV1-27A0A075B6S5 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
IGKV1-27A0A075B6S5 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
IGKV1-27A0A075B6S5 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
IGKV1-27A0A075B6S5 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
IGKV1-27A0A075B6S5 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
IGKV1-27A0A075B6S5 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
IGKV1-27A0A075B6S5 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
IGKV1-27A0A075B6S5 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
IGKV1-27A0A075B6S5 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
IGKV1-27A0A075B6S5 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
IGKV1-27A0A075B6S5 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
IGKV1-27A0A075B6S5 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
IGKV1-27A0A075B6S5 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
IGKV1-27A0A075B6S5 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
IGKV1-27A0A075B6S5 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
IGKV1-27A0A075B6S5 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
IGKV1-27A0A075B6S5 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
IGKV1-27A0A075B6S5 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
IGKV1-27A0A075B6S5 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
IGKV1-27A0A075B6S5 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
IGKV1-27A0A075B6S5 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
IGKV1-27A0A075B6S5 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
IGKV1-27A0A075B6S5 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
IGKV1-27A0A075B6S5 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
IGKV1-27A0A075B6S5 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
IGKV1-27A0A075B6S5 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
IGKV1-27A0A075B6S5 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
IGKV1-27A0A075B6S5 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
IGKV1-27A0A075B6S5 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
IGKV1-27A0A075B6S5 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
IGKV1-27A0A075B6S5 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
IGKV1-27A0A075B6S5 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
IGKV1-27A0A075B6S5 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
IGKV1-27A0A075B6S5 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
IGKV1-27A0A075B6S5 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
IGKV1-27A0A075B6S5 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
IGKV1-27A0A075B6S5 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
IGKV1-27A0A075B6S5 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
IGKV1-27A0A075B6S5 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
IGKV1-27A0A075B6S5 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
IGKV1-27A0A075B6S5 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
IGKV1-27A0A075B6S5 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
IGKV1-27A0A075B6S5 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
IGKV1-27A0A075B6S5 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
IGKV1-27A0A075B6S5 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
IGKV1-27A0A075B6S5 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
IGKV1-27A0A075B6S5 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
IGKV1-27A0A075B6S5 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
IGKV1-27A0A075B6S5 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
IGKV1-27A0A075B6S5 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IGKV1-27A0A075B6S5 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IGKV1-27A0A075B6S5 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IGKV1-27A0A075B6S5 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IGKV1-27A0A075B6S5 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IGKV1-27A0A075B6S5 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IGKV1-27A0A075B6S5 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
IGKV1-27A0A075B6S5 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IGKV1-27A0A075B6S5 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IGKV1-27A0A075B6S5 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IGKV1-27A0A075B6S5 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IGKV1-27A0A075B6S5 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IGKV1-27A0A075B6S5 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
IGKV1-27A0A075B6S5 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IGKV1-27A0A075B6S5 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IGKV1-27A0A075B6S5 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IGKV1-27A0A075B6S5 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IGKV1-27A0A075B6S5 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
IGKV1-27A0A075B6S5 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
IGKV1-27A0A075B6S5 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IGKV1-27A0A075B6S5 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IGKV1-27A0A075B6S5 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
IGKV1-27A0A075B6S5 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
IGKV1-27A0A075B6S5 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
IGKV1-27A0A075B6S5 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
IGKV1-27A0A075B6S5 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IGKV1-27A0A075B6S5 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IGKV1-27A0A075B6S5 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IGKV1-27A0A075B6S5 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
IGKV1-27A0A075B6S5 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
IGKV1-27A0A075B6S5 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IGKV1-27A0A075B6S5 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
IGKV1-27A0A075B6S5 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IGKV1-27A0A075B6S5 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IGKV1-27A0A075B6S5 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IGKV1-27A0A075B6S5 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.2 ms