Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6R9

CCDC61, Coiled-coil domain-containing protein 61, humanhuman

Predictions only

Length 512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC61Q9Y6R9 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCDC61Q9Y6R9 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCDC61Q9Y6R9 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCDC61Q9Y6R9 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCDC61Q9Y6R9 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCDC61Q9Y6R9 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCDC61Q9Y6R9 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCDC61Q9Y6R9 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCDC61Q9Y6R9 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
CCDC61Q9Y6R9 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCDC61Q9Y6R9 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
CCDC61Q9Y6R9 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCDC61Q9Y6R9 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCDC61Q9Y6R9 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCDC61Q9Y6R9 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
CCDC61Q9Y6R9 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CCDC61Q9Y6R9 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CCDC61Q9Y6R9 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CCDC61Q9Y6R9 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CCDC61Q9Y6R9 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CCDC61Q9Y6R9 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CCDC61Q9Y6R9 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CCDC61Q9Y6R9 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CCDC61Q9Y6R9 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CCDC61Q9Y6R9 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CCDC61Q9Y6R9 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CCDC61Q9Y6R9 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC61Q9Y6R9 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC61Q9Y6R9 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC61Q9Y6R9 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC61Q9Y6R9 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC61Q9Y6R9 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC61Q9Y6R9 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC61Q9Y6R9 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC61Q9Y6R9 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC61Q9Y6R9 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC61Q9Y6R9 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC61Q9Y6R9 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC61Q9Y6R9 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC61Q9Y6R9 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC61Q9Y6R9 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC61Q9Y6R9 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC61Q9Y6R9 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC61Q9Y6R9 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC61Q9Y6R9 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC61Q9Y6R9 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC61Q9Y6R9 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC61Q9Y6R9 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC61Q9Y6R9 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC61Q9Y6R9 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC61Q9Y6R9 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC61Q9Y6R9 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC61Q9Y6R9 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC61Q9Y6R9 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC61Q9Y6R9 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC61Q9Y6R9 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC61Q9Y6R9 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC61Q9Y6R9 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC61Q9Y6R9 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC61Q9Y6R9 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC61Q9Y6R9 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC61Q9Y6R9 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC61Q9Y6R9 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC61Q9Y6R9 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC61Q9Y6R9 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC61Q9Y6R9 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC61Q9Y6R9 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC61Q9Y6R9 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC61Q9Y6R9 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC61Q9Y6R9 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC61Q9Y6R9 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC61Q9Y6R9 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC61Q9Y6R9 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC61Q9Y6R9 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC61Q9Y6R9 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC61Q9Y6R9 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC61Q9Y6R9 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC61Q9Y6R9 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC61Q9Y6R9 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC61Q9Y6R9 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC61Q9Y6R9 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC61Q9Y6R9 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC61Q9Y6R9 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC61Q9Y6R9 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC61Q9Y6R9 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC61Q9Y6R9 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC61Q9Y6R9 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC61Q9Y6R9 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC61Q9Y6R9 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC61Q9Y6R9 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC61Q9Y6R9 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC61Q9Y6R9 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC61Q9Y6R9 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC61Q9Y6R9 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC61Q9Y6R9 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC61Q9Y6R9 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC61Q9Y6R9 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC61Q9Y6R9 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC61Q9Y6R9 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC61Q9Y6R9 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms