Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3E1

HDGFL3, Hepatoma-derived growth factor-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDGFL3Q9Y3E1 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HDGFL3Q9Y3E1 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HDGFL3Q9Y3E1 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HDGFL3Q9Y3E1 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HDGFL3Q9Y3E1 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HDGFL3Q9Y3E1 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HDGFL3Q9Y3E1 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HDGFL3Q9Y3E1 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HDGFL3Q9Y3E1 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HDGFL3Q9Y3E1 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
HDGFL3Q9Y3E1 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
HDGFL3Q9Y3E1 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HDGFL3Q9Y3E1 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HDGFL3Q9Y3E1 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HDGFL3Q9Y3E1 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HDGFL3Q9Y3E1 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
HDGFL3Q9Y3E1 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
HDGFL3Q9Y3E1 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HDGFL3Q9Y3E1 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HDGFL3Q9Y3E1 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HDGFL3Q9Y3E1 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HDGFL3Q9Y3E1 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HDGFL3Q9Y3E1 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HDGFL3Q9Y3E1 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HDGFL3Q9Y3E1 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HDGFL3Q9Y3E1 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HDGFL3Q9Y3E1 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HDGFL3Q9Y3E1 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HDGFL3Q9Y3E1 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
HDGFL3Q9Y3E1 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HDGFL3Q9Y3E1 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HDGFL3Q9Y3E1 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HDGFL3Q9Y3E1 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HDGFL3Q9Y3E1 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HDGFL3Q9Y3E1 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HDGFL3Q9Y3E1 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HDGFL3Q9Y3E1 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HDGFL3Q9Y3E1 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HDGFL3Q9Y3E1 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HDGFL3Q9Y3E1 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HDGFL3Q9Y3E1 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HDGFL3Q9Y3E1 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HDGFL3Q9Y3E1 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HDGFL3Q9Y3E1 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HDGFL3Q9Y3E1 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HDGFL3Q9Y3E1 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HDGFL3Q9Y3E1 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HDGFL3Q9Y3E1 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HDGFL3Q9Y3E1 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
HDGFL3Q9Y3E1 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HDGFL3Q9Y3E1 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HDGFL3Q9Y3E1 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
HDGFL3Q9Y3E1 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HDGFL3Q9Y3E1 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HDGFL3Q9Y3E1 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HDGFL3Q9Y3E1 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HDGFL3Q9Y3E1 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HDGFL3Q9Y3E1 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HDGFL3Q9Y3E1 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HDGFL3Q9Y3E1 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HDGFL3Q9Y3E1 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HDGFL3Q9Y3E1 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HDGFL3Q9Y3E1 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HDGFL3Q9Y3E1 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
HDGFL3Q9Y3E1 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HDGFL3Q9Y3E1 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HDGFL3Q9Y3E1 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HDGFL3Q9Y3E1 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HDGFL3Q9Y3E1 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HDGFL3Q9Y3E1 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HDGFL3Q9Y3E1 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HDGFL3Q9Y3E1 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HDGFL3Q9Y3E1 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HDGFL3Q9Y3E1 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
HDGFL3Q9Y3E1 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HDGFL3Q9Y3E1 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HDGFL3Q9Y3E1 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HDGFL3Q9Y3E1 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
HDGFL3Q9Y3E1 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HDGFL3Q9Y3E1 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HDGFL3Q9Y3E1 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
HDGFL3Q9Y3E1 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HDGFL3Q9Y3E1 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HDGFL3Q9Y3E1 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HDGFL3Q9Y3E1 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HDGFL3Q9Y3E1 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HDGFL3Q9Y3E1 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HDGFL3Q9Y3E1 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HDGFL3Q9Y3E1 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HDGFL3Q9Y3E1 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HDGFL3Q9Y3E1 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HDGFL3Q9Y3E1 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HDGFL3Q9Y3E1 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HDGFL3Q9Y3E1 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HDGFL3Q9Y3E1 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HDGFL3Q9Y3E1 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HDGFL3Q9Y3E1 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HDGFL3Q9Y3E1 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HDGFL3Q9Y3E1 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HDGFL3Q9Y3E1 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms