Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y376

CAB39, Calcium-binding protein 39, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 341 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAB39Q9Y376 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CAB39Q9Y376 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CAB39Q9Y376 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CAB39Q9Y376 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CAB39Q9Y376 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CAB39Q9Y376 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CAB39Q9Y376 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CAB39Q9Y376 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CAB39Q9Y376 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CAB39Q9Y376 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CAB39Q9Y376 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CAB39Q9Y376 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CAB39Q9Y376 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CAB39Q9Y376 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CAB39Q9Y376 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CAB39Q9Y376 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CAB39Q9Y376 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CAB39Q9Y376 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CAB39Q9Y376 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CAB39Q9Y376 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CAB39Q9Y376 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CAB39Q9Y376 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CAB39Q9Y376 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CAB39Q9Y376 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CAB39Q9Y376 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CAB39Q9Y376 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CAB39Q9Y376 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CAB39Q9Y376 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CAB39Q9Y376 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CAB39Q9Y376 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CAB39Q9Y376 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CAB39Q9Y376 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CAB39Q9Y376 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CAB39Q9Y376 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CAB39Q9Y376 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CAB39Q9Y376 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CAB39Q9Y376 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CAB39Q9Y376 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CAB39Q9Y376 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CAB39Q9Y376 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CAB39Q9Y376 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CAB39Q9Y376 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CAB39Q9Y376 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CAB39Q9Y376 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CAB39Q9Y376 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CAB39Q9Y376 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CAB39Q9Y376 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CAB39Q9Y376 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CAB39Q9Y376 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CAB39Q9Y376 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CAB39Q9Y376 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CAB39Q9Y376 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CAB39Q9Y376 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CAB39Q9Y376 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CAB39Q9Y376 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CAB39Q9Y376 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CAB39Q9Y376 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CAB39Q9Y376 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CAB39Q9Y376 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CAB39Q9Y376 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CAB39Q9Y376 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CAB39Q9Y376 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CAB39Q9Y376 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CAB39Q9Y376 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CAB39Q9Y376 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CAB39Q9Y376 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CAB39Q9Y376 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CAB39Q9Y376 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CAB39Q9Y376 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CAB39Q9Y376 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CAB39Q9Y376 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CAB39Q9Y376 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CAB39Q9Y376 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CAB39Q9Y376 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CAB39Q9Y376 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CAB39Q9Y376 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CAB39Q9Y376 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CAB39Q9Y376 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CAB39Q9Y376 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CAB39Q9Y376 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CAB39Q9Y376 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CAB39Q9Y376 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CAB39Q9Y376 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CAB39Q9Y376 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CAB39Q9Y376 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CAB39Q9Y376 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
CAB39Q9Y376 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
CAB39Q9Y376 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
CAB39Q9Y376 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CAB39Q9Y376 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CAB39Q9Y376 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CAB39Q9Y376 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CAB39Q9Y376 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CAB39Q9Y376 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CAB39Q9Y376 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CAB39Q9Y376 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CAB39Q9Y376 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CAB39Q9Y376 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CAB39Q9Y376 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CAB39Q9Y376 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms