Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2K7

KDM2A, Lysine-specific demethylase 2A, humanhuman

Predictions only

Length 1,162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM2AQ9Y2K7 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
KDM2AQ9Y2K7 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
KDM2AQ9Y2K7 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
KDM2AQ9Y2K7 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
KDM2AQ9Y2K7 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
KDM2AQ9Y2K7 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
KDM2AQ9Y2K7 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
KDM2AQ9Y2K7 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
KDM2AQ9Y2K7 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
KDM2AQ9Y2K7 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
KDM2AQ9Y2K7 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
KDM2AQ9Y2K7 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
KDM2AQ9Y2K7 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
KDM2AQ9Y2K7 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
KDM2AQ9Y2K7 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
KDM2AQ9Y2K7 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
KDM2AQ9Y2K7 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
KDM2AQ9Y2K7 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
KDM2AQ9Y2K7 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
KDM2AQ9Y2K7 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
KDM2AQ9Y2K7 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC26.06■■□□□ 1.76
KDM2AQ9Y2K7 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
KDM2AQ9Y2K7 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
KDM2AQ9Y2K7 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
KDM2AQ9Y2K7 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
KDM2AQ9Y2K7 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
KDM2AQ9Y2K7 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
KDM2AQ9Y2K7 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
KDM2AQ9Y2K7 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
KDM2AQ9Y2K7 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
KDM2AQ9Y2K7 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
KDM2AQ9Y2K7 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
KDM2AQ9Y2K7 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
KDM2AQ9Y2K7 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
KDM2AQ9Y2K7 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
KDM2AQ9Y2K7 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
KDM2AQ9Y2K7 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
KDM2AQ9Y2K7 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
KDM2AQ9Y2K7 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
KDM2AQ9Y2K7 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
KDM2AQ9Y2K7 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
KDM2AQ9Y2K7 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
KDM2AQ9Y2K7 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
KDM2AQ9Y2K7 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
KDM2AQ9Y2K7 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
KDM2AQ9Y2K7 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
KDM2AQ9Y2K7 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
KDM2AQ9Y2K7 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
KDM2AQ9Y2K7 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
KDM2AQ9Y2K7 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
KDM2AQ9Y2K7 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
KDM2AQ9Y2K7 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
KDM2AQ9Y2K7 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
KDM2AQ9Y2K7 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
KDM2AQ9Y2K7 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
KDM2AQ9Y2K7 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
KDM2AQ9Y2K7 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
KDM2AQ9Y2K7 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
KDM2AQ9Y2K7 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
KDM2AQ9Y2K7 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
KDM2AQ9Y2K7 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
KDM2AQ9Y2K7 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
KDM2AQ9Y2K7 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
KDM2AQ9Y2K7 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
KDM2AQ9Y2K7 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
KDM2AQ9Y2K7 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
KDM2AQ9Y2K7 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
KDM2AQ9Y2K7 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
KDM2AQ9Y2K7 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
KDM2AQ9Y2K7 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
KDM2AQ9Y2K7 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
KDM2AQ9Y2K7 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
KDM2AQ9Y2K7 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
KDM2AQ9Y2K7 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
KDM2AQ9Y2K7 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
KDM2AQ9Y2K7 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
KDM2AQ9Y2K7 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
KDM2AQ9Y2K7 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
KDM2AQ9Y2K7 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
KDM2AQ9Y2K7 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
KDM2AQ9Y2K7 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
KDM2AQ9Y2K7 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
KDM2AQ9Y2K7 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
KDM2AQ9Y2K7 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
KDM2AQ9Y2K7 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
KDM2AQ9Y2K7 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
KDM2AQ9Y2K7 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.76
KDM2AQ9Y2K7 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
KDM2AQ9Y2K7 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
KDM2AQ9Y2K7 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
KDM2AQ9Y2K7 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
KDM2AQ9Y2K7 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
KDM2AQ9Y2K7 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
KDM2AQ9Y2K7 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
KDM2AQ9Y2K7 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
KDM2AQ9Y2K7 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
KDM2AQ9Y2K7 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
KDM2AQ9Y2K7 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
KDM2AQ9Y2K7 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
KDM2AQ9Y2K7 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms