Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2I6

NINL, Ninein-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NINLQ9Y2I6 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NINLQ9Y2I6 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NINLQ9Y2I6 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NINLQ9Y2I6 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
NINLQ9Y2I6 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NINLQ9Y2I6 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NINLQ9Y2I6 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NINLQ9Y2I6 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NINLQ9Y2I6 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NINLQ9Y2I6 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
NINLQ9Y2I6 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
NINLQ9Y2I6 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
NINLQ9Y2I6 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
NINLQ9Y2I6 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
NINLQ9Y2I6 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
NINLQ9Y2I6 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
NINLQ9Y2I6 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
NINLQ9Y2I6 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
NINLQ9Y2I6 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.57
NINLQ9Y2I6 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.57
NINLQ9Y2I6 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.89■■□□□ 1.57
NINLQ9Y2I6 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
NINLQ9Y2I6 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
NINLQ9Y2I6 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
NINLQ9Y2I6 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
NINLQ9Y2I6 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
NINLQ9Y2I6 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NINLQ9Y2I6 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NINLQ9Y2I6 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NINLQ9Y2I6 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NINLQ9Y2I6 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NINLQ9Y2I6 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NINLQ9Y2I6 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NINLQ9Y2I6 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NINLQ9Y2I6 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NINLQ9Y2I6 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NINLQ9Y2I6 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NINLQ9Y2I6 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NINLQ9Y2I6 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NINLQ9Y2I6 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
NINLQ9Y2I6 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NINLQ9Y2I6 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NINLQ9Y2I6 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NINLQ9Y2I6 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NINLQ9Y2I6 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NINLQ9Y2I6 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NINLQ9Y2I6 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NINLQ9Y2I6 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
NINLQ9Y2I6 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NINLQ9Y2I6 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NINLQ9Y2I6 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
NINLQ9Y2I6 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NINLQ9Y2I6 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NINLQ9Y2I6 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
NINLQ9Y2I6 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NINLQ9Y2I6 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NINLQ9Y2I6 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NINLQ9Y2I6 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NINLQ9Y2I6 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
NINLQ9Y2I6 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NINLQ9Y2I6 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NINLQ9Y2I6 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NINLQ9Y2I6 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NINLQ9Y2I6 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NINLQ9Y2I6 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NINLQ9Y2I6 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NINLQ9Y2I6 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NINLQ9Y2I6 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
NINLQ9Y2I6 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NINLQ9Y2I6 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NINLQ9Y2I6 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NINLQ9Y2I6 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NINLQ9Y2I6 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NINLQ9Y2I6 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NINLQ9Y2I6 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NINLQ9Y2I6 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NINLQ9Y2I6 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NINLQ9Y2I6 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NINLQ9Y2I6 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
NINLQ9Y2I6 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NINLQ9Y2I6 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NINLQ9Y2I6 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
NINLQ9Y2I6 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NINLQ9Y2I6 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NINLQ9Y2I6 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NINLQ9Y2I6 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NINLQ9Y2I6 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
NINLQ9Y2I6 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NINLQ9Y2I6 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
NINLQ9Y2I6 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NINLQ9Y2I6 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NINLQ9Y2I6 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NINLQ9Y2I6 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NINLQ9Y2I6 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NINLQ9Y2I6 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NINLQ9Y2I6 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NINLQ9Y2I6 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NINLQ9Y2I6 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
NINLQ9Y2I6 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NINLQ9Y2I6 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms