Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y296

TRAPPC4, Trafficking protein particle complex subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC4Q9Y296 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRAPPC4Q9Y296 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRAPPC4Q9Y296 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
TRAPPC4Q9Y296 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRAPPC4Q9Y296 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRAPPC4Q9Y296 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
TRAPPC4Q9Y296 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRAPPC4Q9Y296 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRAPPC4Q9Y296 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRAPPC4Q9Y296 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRAPPC4Q9Y296 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRAPPC4Q9Y296 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRAPPC4Q9Y296 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRAPPC4Q9Y296 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRAPPC4Q9Y296 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRAPPC4Q9Y296 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRAPPC4Q9Y296 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
TRAPPC4Q9Y296 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRAPPC4Q9Y296 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRAPPC4Q9Y296 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRAPPC4Q9Y296 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRAPPC4Q9Y296 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRAPPC4Q9Y296 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRAPPC4Q9Y296 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRAPPC4Q9Y296 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRAPPC4Q9Y296 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRAPPC4Q9Y296 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRAPPC4Q9Y296 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
TRAPPC4Q9Y296 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRAPPC4Q9Y296 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRAPPC4Q9Y296 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
TRAPPC4Q9Y296 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
TRAPPC4Q9Y296 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRAPPC4Q9Y296 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRAPPC4Q9Y296 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRAPPC4Q9Y296 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRAPPC4Q9Y296 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRAPPC4Q9Y296 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRAPPC4Q9Y296 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRAPPC4Q9Y296 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRAPPC4Q9Y296 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRAPPC4Q9Y296 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRAPPC4Q9Y296 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TRAPPC4Q9Y296 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TRAPPC4Q9Y296 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TRAPPC4Q9Y296 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TRAPPC4Q9Y296 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TRAPPC4Q9Y296 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TRAPPC4Q9Y296 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TRAPPC4Q9Y296 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TRAPPC4Q9Y296 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
TRAPPC4Q9Y296 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TRAPPC4Q9Y296 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TRAPPC4Q9Y296 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TRAPPC4Q9Y296 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TRAPPC4Q9Y296 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TRAPPC4Q9Y296 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TRAPPC4Q9Y296 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TRAPPC4Q9Y296 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TRAPPC4Q9Y296 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TRAPPC4Q9Y296 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TRAPPC4Q9Y296 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TRAPPC4Q9Y296 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TRAPPC4Q9Y296 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TRAPPC4Q9Y296 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TRAPPC4Q9Y296 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TRAPPC4Q9Y296 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TRAPPC4Q9Y296 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
TRAPPC4Q9Y296 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
TRAPPC4Q9Y296 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TRAPPC4Q9Y296 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TRAPPC4Q9Y296 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
TRAPPC4Q9Y296 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TRAPPC4Q9Y296 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
TRAPPC4Q9Y296 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.27
TRAPPC4Q9Y296 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TRAPPC4Q9Y296 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
TRAPPC4Q9Y296 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TRAPPC4Q9Y296 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
TRAPPC4Q9Y296 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRAPPC4Q9Y296 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRAPPC4Q9Y296 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRAPPC4Q9Y296 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRAPPC4Q9Y296 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRAPPC4Q9Y296 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRAPPC4Q9Y296 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRAPPC4Q9Y296 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRAPPC4Q9Y296 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRAPPC4Q9Y296 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRAPPC4Q9Y296 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRAPPC4Q9Y296 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRAPPC4Q9Y296 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRAPPC4Q9Y296 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRAPPC4Q9Y296 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRAPPC4Q9Y296 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRAPPC4Q9Y296 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRAPPC4Q9Y296 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRAPPC4Q9Y296 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRAPPC4Q9Y296 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRAPPC4Q9Y296 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms