Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y266

NUDC, Nuclear migration protein nudC, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUDCQ9Y266 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NUDCQ9Y266 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NUDCQ9Y266 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NUDCQ9Y266 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NUDCQ9Y266 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NUDCQ9Y266 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NUDCQ9Y266 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
NUDCQ9Y266 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NUDCQ9Y266 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
NUDCQ9Y266 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NUDCQ9Y266 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NUDCQ9Y266 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NUDCQ9Y266 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NUDCQ9Y266 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NUDCQ9Y266 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NUDCQ9Y266 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NUDCQ9Y266 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NUDCQ9Y266 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NUDCQ9Y266 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NUDCQ9Y266 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NUDCQ9Y266 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NUDCQ9Y266 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NUDCQ9Y266 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NUDCQ9Y266 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
NUDCQ9Y266 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NUDCQ9Y266 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NUDCQ9Y266 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NUDCQ9Y266 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NUDCQ9Y266 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NUDCQ9Y266 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NUDCQ9Y266 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NUDCQ9Y266 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NUDCQ9Y266 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NUDCQ9Y266 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NUDCQ9Y266 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
NUDCQ9Y266 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NUDCQ9Y266 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NUDCQ9Y266 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NUDCQ9Y266 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NUDCQ9Y266 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NUDCQ9Y266 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NUDCQ9Y266 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NUDCQ9Y266 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NUDCQ9Y266 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NUDCQ9Y266 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NUDCQ9Y266 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NUDCQ9Y266 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NUDCQ9Y266 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
NUDCQ9Y266 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
NUDCQ9Y266 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NUDCQ9Y266 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NUDCQ9Y266 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NUDCQ9Y266 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NUDCQ9Y266 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NUDCQ9Y266 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NUDCQ9Y266 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NUDCQ9Y266 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NUDCQ9Y266 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NUDCQ9Y266 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
NUDCQ9Y266 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NUDCQ9Y266 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NUDCQ9Y266 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
NUDCQ9Y266 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NUDCQ9Y266 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NUDCQ9Y266 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NUDCQ9Y266 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NUDCQ9Y266 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NUDCQ9Y266 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NUDCQ9Y266 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
NUDCQ9Y266 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NUDCQ9Y266 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NUDCQ9Y266 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NUDCQ9Y266 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NUDCQ9Y266 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NUDCQ9Y266 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NUDCQ9Y266 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NUDCQ9Y266 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NUDCQ9Y266 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NUDCQ9Y266 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NUDCQ9Y266 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NUDCQ9Y266 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NUDCQ9Y266 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NUDCQ9Y266 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NUDCQ9Y266 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
NUDCQ9Y266 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NUDCQ9Y266 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NUDCQ9Y266 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NUDCQ9Y266 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
NUDCQ9Y266 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NUDCQ9Y266 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NUDCQ9Y266 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NUDCQ9Y266 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NUDCQ9Y266 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NUDCQ9Y266 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NUDCQ9Y266 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NUDCQ9Y266 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NUDCQ9Y266 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NUDCQ9Y266 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NUDCQ9Y266 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NUDCQ9Y266 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms