Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQF0

ERVW-1, Syncytin-1, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVW-1Q9UQF0 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ERVW-1Q9UQF0 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ERVW-1Q9UQF0 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ERVW-1Q9UQF0 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ERVW-1Q9UQF0 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ERVW-1Q9UQF0 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ERVW-1Q9UQF0 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ERVW-1Q9UQF0 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ERVW-1Q9UQF0 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ERVW-1Q9UQF0 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ERVW-1Q9UQF0 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ERVW-1Q9UQF0 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ERVW-1Q9UQF0 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ERVW-1Q9UQF0 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ERVW-1Q9UQF0 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ERVW-1Q9UQF0 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ERVW-1Q9UQF0 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ERVW-1Q9UQF0 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ERVW-1Q9UQF0 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ERVW-1Q9UQF0 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ERVW-1Q9UQF0 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ERVW-1Q9UQF0 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
ERVW-1Q9UQF0 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ERVW-1Q9UQF0 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ERVW-1Q9UQF0 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ERVW-1Q9UQF0 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ERVW-1Q9UQF0 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ERVW-1Q9UQF0 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ERVW-1Q9UQF0 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ERVW-1Q9UQF0 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ERVW-1Q9UQF0 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ERVW-1Q9UQF0 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ERVW-1Q9UQF0 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ERVW-1Q9UQF0 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ERVW-1Q9UQF0 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ERVW-1Q9UQF0 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ERVW-1Q9UQF0 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ERVW-1Q9UQF0 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ERVW-1Q9UQF0 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ERVW-1Q9UQF0 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ERVW-1Q9UQF0 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ERVW-1Q9UQF0 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ERVW-1Q9UQF0 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
ERVW-1Q9UQF0 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ERVW-1Q9UQF0 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ERVW-1Q9UQF0 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ERVW-1Q9UQF0 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ERVW-1Q9UQF0 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ERVW-1Q9UQF0 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ERVW-1Q9UQF0 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ERVW-1Q9UQF0 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ERVW-1Q9UQF0 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ERVW-1Q9UQF0 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.55
ERVW-1Q9UQF0 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
ERVW-1Q9UQF0 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ERVW-1Q9UQF0 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
ERVW-1Q9UQF0 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.55
ERVW-1Q9UQF0 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ERVW-1Q9UQF0 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ERVW-1Q9UQF0 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ERVW-1Q9UQF0 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ERVW-1Q9UQF0 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ERVW-1Q9UQF0 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ERVW-1Q9UQF0 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ERVW-1Q9UQF0 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ERVW-1Q9UQF0 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ERVW-1Q9UQF0 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ERVW-1Q9UQF0 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ERVW-1Q9UQF0 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
ERVW-1Q9UQF0 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ERVW-1Q9UQF0 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ERVW-1Q9UQF0 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ERVW-1Q9UQF0 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ERVW-1Q9UQF0 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
ERVW-1Q9UQF0 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
ERVW-1Q9UQF0 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ERVW-1Q9UQF0 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ERVW-1Q9UQF0 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ERVW-1Q9UQF0 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ERVW-1Q9UQF0 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
ERVW-1Q9UQF0 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ERVW-1Q9UQF0 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ERVW-1Q9UQF0 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ERVW-1Q9UQF0 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ERVW-1Q9UQF0 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ERVW-1Q9UQF0 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ERVW-1Q9UQF0 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ERVW-1Q9UQF0 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ERVW-1Q9UQF0 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ERVW-1Q9UQF0 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ERVW-1Q9UQF0 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ERVW-1Q9UQF0 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ERVW-1Q9UQF0 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ERVW-1Q9UQF0 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ERVW-1Q9UQF0 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ERVW-1Q9UQF0 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ERVW-1Q9UQF0 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ERVW-1Q9UQF0 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
ERVW-1Q9UQF0 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
ERVW-1Q9UQF0 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms