Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPP1

PHF8, Histone lysine demethylase PHF8, humanhuman

Predictions only

Length 1,060 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF8Q9UPP1 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PHF8Q9UPP1 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PHF8Q9UPP1 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PHF8Q9UPP1 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PHF8Q9UPP1 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PHF8Q9UPP1 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PHF8Q9UPP1 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PHF8Q9UPP1 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PHF8Q9UPP1 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PHF8Q9UPP1 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PHF8Q9UPP1 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PHF8Q9UPP1 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PHF8Q9UPP1 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PHF8Q9UPP1 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PHF8Q9UPP1 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PHF8Q9UPP1 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PHF8Q9UPP1 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PHF8Q9UPP1 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PHF8Q9UPP1 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PHF8Q9UPP1 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PHF8Q9UPP1 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PHF8Q9UPP1 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PHF8Q9UPP1 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PHF8Q9UPP1 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PHF8Q9UPP1 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PHF8Q9UPP1 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PHF8Q9UPP1 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PHF8Q9UPP1 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
PHF8Q9UPP1 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PHF8Q9UPP1 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PHF8Q9UPP1 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PHF8Q9UPP1 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PHF8Q9UPP1 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PHF8Q9UPP1 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
PHF8Q9UPP1 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
PHF8Q9UPP1 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PHF8Q9UPP1 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PHF8Q9UPP1 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PHF8Q9UPP1 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PHF8Q9UPP1 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
PHF8Q9UPP1 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
PHF8Q9UPP1 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
PHF8Q9UPP1 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
PHF8Q9UPP1 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PHF8Q9UPP1 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PHF8Q9UPP1 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PHF8Q9UPP1 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PHF8Q9UPP1 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
PHF8Q9UPP1 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PHF8Q9UPP1 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PHF8Q9UPP1 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PHF8Q9UPP1 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PHF8Q9UPP1 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PHF8Q9UPP1 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PHF8Q9UPP1 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PHF8Q9UPP1 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PHF8Q9UPP1 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PHF8Q9UPP1 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PHF8Q9UPP1 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PHF8Q9UPP1 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PHF8Q9UPP1 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PHF8Q9UPP1 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PHF8Q9UPP1 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PHF8Q9UPP1 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
PHF8Q9UPP1 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PHF8Q9UPP1 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PHF8Q9UPP1 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PHF8Q9UPP1 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PHF8Q9UPP1 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PHF8Q9UPP1 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PHF8Q9UPP1 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PHF8Q9UPP1 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PHF8Q9UPP1 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PHF8Q9UPP1 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PHF8Q9UPP1 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PHF8Q9UPP1 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PHF8Q9UPP1 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PHF8Q9UPP1 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PHF8Q9UPP1 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PHF8Q9UPP1 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PHF8Q9UPP1 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PHF8Q9UPP1 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PHF8Q9UPP1 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PHF8Q9UPP1 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PHF8Q9UPP1 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PHF8Q9UPP1 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PHF8Q9UPP1 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PHF8Q9UPP1 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PHF8Q9UPP1 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PHF8Q9UPP1 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PHF8Q9UPP1 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PHF8Q9UPP1 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PHF8Q9UPP1 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PHF8Q9UPP1 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PHF8Q9UPP1 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PHF8Q9UPP1 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PHF8Q9UPP1 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PHF8Q9UPP1 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
PHF8Q9UPP1 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
PHF8Q9UPP1 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms