Protein–RNA interactions for Protein: Q9UP95

SLC12A4, Solute carrier family 12 member 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,085 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC12A4Q9UP95 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC12A4Q9UP95 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC12A4Q9UP95 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC12A4Q9UP95 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC12A4Q9UP95 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC12A4Q9UP95 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC12A4Q9UP95 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC12A4Q9UP95 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC12A4Q9UP95 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC12A4Q9UP95 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC12A4Q9UP95 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC12A4Q9UP95 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC12A4Q9UP95 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC12A4Q9UP95 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC12A4Q9UP95 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC12A4Q9UP95 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC12A4Q9UP95 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC12A4Q9UP95 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC12A4Q9UP95 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC12A4Q9UP95 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC12A4Q9UP95 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC12A4Q9UP95 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC12A4Q9UP95 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC12A4Q9UP95 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC12A4Q9UP95 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC12A4Q9UP95 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC12A4Q9UP95 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC12A4Q9UP95 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC12A4Q9UP95 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC12A4Q9UP95 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC12A4Q9UP95 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC12A4Q9UP95 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC12A4Q9UP95 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC12A4Q9UP95 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC12A4Q9UP95 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC12A4Q9UP95 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC12A4Q9UP95 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC12A4Q9UP95 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC12A4Q9UP95 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC12A4Q9UP95 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC12A4Q9UP95 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC12A4Q9UP95 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC12A4Q9UP95 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC12A4Q9UP95 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC12A4Q9UP95 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC12A4Q9UP95 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC12A4Q9UP95 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC12A4Q9UP95 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC12A4Q9UP95 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC12A4Q9UP95 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC12A4Q9UP95 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC12A4Q9UP95 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC12A4Q9UP95 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC12A4Q9UP95 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC12A4Q9UP95 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC12A4Q9UP95 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC12A4Q9UP95 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC12A4Q9UP95 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC12A4Q9UP95 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC12A4Q9UP95 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC12A4Q9UP95 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC12A4Q9UP95 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC12A4Q9UP95 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC12A4Q9UP95 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC12A4Q9UP95 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC12A4Q9UP95 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC12A4Q9UP95 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC12A4Q9UP95 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC12A4Q9UP95 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC12A4Q9UP95 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC12A4Q9UP95 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC12A4Q9UP95 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC12A4Q9UP95 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC12A4Q9UP95 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC12A4Q9UP95 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC12A4Q9UP95 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC12A4Q9UP95 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC12A4Q9UP95 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC12A4Q9UP95 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC12A4Q9UP95 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC12A4Q9UP95 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC12A4Q9UP95 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC12A4Q9UP95 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC12A4Q9UP95 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC12A4Q9UP95 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC12A4Q9UP95 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC12A4Q9UP95 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC12A4Q9UP95 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC12A4Q9UP95 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC12A4Q9UP95 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC12A4Q9UP95 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC12A4Q9UP95 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC12A4Q9UP95 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC12A4Q9UP95 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC12A4Q9UP95 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC12A4Q9UP95 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC12A4Q9UP95 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC12A4Q9UP95 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC12A4Q9UP95 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC12A4Q9UP95 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms