Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNH6

SNX7, Sorting nexin-7, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX7Q9UNH6 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SNX7Q9UNH6 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SNX7Q9UNH6 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SNX7Q9UNH6 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SNX7Q9UNH6 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SNX7Q9UNH6 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SNX7Q9UNH6 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SNX7Q9UNH6 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SNX7Q9UNH6 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SNX7Q9UNH6 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SNX7Q9UNH6 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SNX7Q9UNH6 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SNX7Q9UNH6 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SNX7Q9UNH6 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SNX7Q9UNH6 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SNX7Q9UNH6 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SNX7Q9UNH6 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SNX7Q9UNH6 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
SNX7Q9UNH6 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
SNX7Q9UNH6 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SNX7Q9UNH6 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
SNX7Q9UNH6 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SNX7Q9UNH6 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
SNX7Q9UNH6 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SNX7Q9UNH6 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SNX7Q9UNH6 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
SNX7Q9UNH6 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SNX7Q9UNH6 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SNX7Q9UNH6 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SNX7Q9UNH6 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SNX7Q9UNH6 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SNX7Q9UNH6 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SNX7Q9UNH6 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SNX7Q9UNH6 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
SNX7Q9UNH6 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SNX7Q9UNH6 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SNX7Q9UNH6 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
SNX7Q9UNH6 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SNX7Q9UNH6 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SNX7Q9UNH6 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SNX7Q9UNH6 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SNX7Q9UNH6 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SNX7Q9UNH6 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SNX7Q9UNH6 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SNX7Q9UNH6 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
SNX7Q9UNH6 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SNX7Q9UNH6 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
SNX7Q9UNH6 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
SNX7Q9UNH6 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SNX7Q9UNH6 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SNX7Q9UNH6 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SNX7Q9UNH6 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SNX7Q9UNH6 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SNX7Q9UNH6 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
SNX7Q9UNH6 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
SNX7Q9UNH6 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
SNX7Q9UNH6 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
SNX7Q9UNH6 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.42
SNX7Q9UNH6 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SNX7Q9UNH6 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SNX7Q9UNH6 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
SNX7Q9UNH6 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SNX7Q9UNH6 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SNX7Q9UNH6 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SNX7Q9UNH6 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SNX7Q9UNH6 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SNX7Q9UNH6 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SNX7Q9UNH6 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
SNX7Q9UNH6 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SNX7Q9UNH6 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SNX7Q9UNH6 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SNX7Q9UNH6 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SNX7Q9UNH6 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
SNX7Q9UNH6 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
SNX7Q9UNH6 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SNX7Q9UNH6 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SNX7Q9UNH6 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SNX7Q9UNH6 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
SNX7Q9UNH6 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SNX7Q9UNH6 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SNX7Q9UNH6 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SNX7Q9UNH6 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SNX7Q9UNH6 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SNX7Q9UNH6 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SNX7Q9UNH6 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SNX7Q9UNH6 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SNX7Q9UNH6 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SNX7Q9UNH6 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SNX7Q9UNH6 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
SNX7Q9UNH6 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SNX7Q9UNH6 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SNX7Q9UNH6 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SNX7Q9UNH6 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SNX7Q9UNH6 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SNX7Q9UNH6 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SNX7Q9UNH6 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SNX7Q9UNH6 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SNX7Q9UNH6 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SNX7Q9UNH6 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SNX7Q9UNH6 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms