Protein–RNA interactions for Protein: Q9UN81

L1RE1, LINE-1 retrotransposable element ORF1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
L1RE1Q9UN81 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
L1RE1Q9UN81 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
L1RE1Q9UN81 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
L1RE1Q9UN81 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
L1RE1Q9UN81 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
L1RE1Q9UN81 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
L1RE1Q9UN81 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
L1RE1Q9UN81 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
L1RE1Q9UN81 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
L1RE1Q9UN81 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
L1RE1Q9UN81 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
L1RE1Q9UN81 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
L1RE1Q9UN81 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
L1RE1Q9UN81 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
L1RE1Q9UN81 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
L1RE1Q9UN81 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
L1RE1Q9UN81 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
L1RE1Q9UN81 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
L1RE1Q9UN81 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
L1RE1Q9UN81 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
L1RE1Q9UN81 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
L1RE1Q9UN81 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
L1RE1Q9UN81 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
L1RE1Q9UN81 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
L1RE1Q9UN81 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
L1RE1Q9UN81 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
L1RE1Q9UN81 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
L1RE1Q9UN81 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
L1RE1Q9UN81 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
L1RE1Q9UN81 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
L1RE1Q9UN81 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
L1RE1Q9UN81 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
L1RE1Q9UN81 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
L1RE1Q9UN81 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
L1RE1Q9UN81 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
L1RE1Q9UN81 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
L1RE1Q9UN81 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
L1RE1Q9UN81 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
L1RE1Q9UN81 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
L1RE1Q9UN81 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
L1RE1Q9UN81 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
L1RE1Q9UN81 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
L1RE1Q9UN81 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
L1RE1Q9UN81 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
L1RE1Q9UN81 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
L1RE1Q9UN81 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
L1RE1Q9UN81 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
L1RE1Q9UN81 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
L1RE1Q9UN81 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
L1RE1Q9UN81 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
L1RE1Q9UN81 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
L1RE1Q9UN81 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
L1RE1Q9UN81 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
L1RE1Q9UN81 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
L1RE1Q9UN81 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
L1RE1Q9UN81 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
L1RE1Q9UN81 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
L1RE1Q9UN81 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
L1RE1Q9UN81 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
L1RE1Q9UN81 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
L1RE1Q9UN81 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
L1RE1Q9UN81 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
L1RE1Q9UN81 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
L1RE1Q9UN81 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
L1RE1Q9UN81 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
L1RE1Q9UN81 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
L1RE1Q9UN81 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
L1RE1Q9UN81 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
L1RE1Q9UN81 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
L1RE1Q9UN81 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
L1RE1Q9UN81 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
L1RE1Q9UN81 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
L1RE1Q9UN81 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
L1RE1Q9UN81 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
L1RE1Q9UN81 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
L1RE1Q9UN81 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
L1RE1Q9UN81 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
L1RE1Q9UN81 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
L1RE1Q9UN81 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
L1RE1Q9UN81 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
L1RE1Q9UN81 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
L1RE1Q9UN81 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
L1RE1Q9UN81 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
L1RE1Q9UN81 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
L1RE1Q9UN81 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
L1RE1Q9UN81 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
L1RE1Q9UN81 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
L1RE1Q9UN81 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
L1RE1Q9UN81 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
L1RE1Q9UN81 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
L1RE1Q9UN81 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
L1RE1Q9UN81 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
L1RE1Q9UN81 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
L1RE1Q9UN81 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
L1RE1Q9UN81 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
L1RE1Q9UN81 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
L1RE1Q9UN81 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
L1RE1Q9UN81 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
L1RE1Q9UN81 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
L1RE1Q9UN81 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms