Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULU4

ZMYND8, Protein kinase C-binding protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,186 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZMYND8Q9ULU4 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ZMYND8Q9ULU4 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ZMYND8Q9ULU4 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ZMYND8Q9ULU4 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ZMYND8Q9ULU4 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ZMYND8Q9ULU4 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ZMYND8Q9ULU4 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ZMYND8Q9ULU4 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ZMYND8Q9ULU4 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ZMYND8Q9ULU4 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ZMYND8Q9ULU4 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ZMYND8Q9ULU4 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
ZMYND8Q9ULU4 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ZMYND8Q9ULU4 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ZMYND8Q9ULU4 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ZMYND8Q9ULU4 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
ZMYND8Q9ULU4 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ZMYND8Q9ULU4 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ZMYND8Q9ULU4 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ZMYND8Q9ULU4 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ZMYND8Q9ULU4 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ZMYND8Q9ULU4 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ZMYND8Q9ULU4 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ZMYND8Q9ULU4 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ZMYND8Q9ULU4 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ZMYND8Q9ULU4 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ZMYND8Q9ULU4 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ZMYND8Q9ULU4 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ZMYND8Q9ULU4 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ZMYND8Q9ULU4 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ZMYND8Q9ULU4 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ZMYND8Q9ULU4 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ZMYND8Q9ULU4 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ZMYND8Q9ULU4 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
ZMYND8Q9ULU4 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ZMYND8Q9ULU4 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ZMYND8Q9ULU4 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ZMYND8Q9ULU4 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ZMYND8Q9ULU4 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ZMYND8Q9ULU4 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
ZMYND8Q9ULU4 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ZMYND8Q9ULU4 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ZMYND8Q9ULU4 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ZMYND8Q9ULU4 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
ZMYND8Q9ULU4 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ZMYND8Q9ULU4 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ZMYND8Q9ULU4 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ZMYND8Q9ULU4 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ZMYND8Q9ULU4 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ZMYND8Q9ULU4 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ZMYND8Q9ULU4 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ZMYND8Q9ULU4 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ZMYND8Q9ULU4 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ZMYND8Q9ULU4 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ZMYND8Q9ULU4 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ZMYND8Q9ULU4 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ZMYND8Q9ULU4 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ZMYND8Q9ULU4 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ZMYND8Q9ULU4 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ZMYND8Q9ULU4 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ZMYND8Q9ULU4 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ZMYND8Q9ULU4 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ZMYND8Q9ULU4 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ZMYND8Q9ULU4 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ZMYND8Q9ULU4 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ZMYND8Q9ULU4 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ZMYND8Q9ULU4 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
ZMYND8Q9ULU4 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ZMYND8Q9ULU4 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ZMYND8Q9ULU4 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ZMYND8Q9ULU4 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
ZMYND8Q9ULU4 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ZMYND8Q9ULU4 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ZMYND8Q9ULU4 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ZMYND8Q9ULU4 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ZMYND8Q9ULU4 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ZMYND8Q9ULU4 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ZMYND8Q9ULU4 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ZMYND8Q9ULU4 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ZMYND8Q9ULU4 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ZMYND8Q9ULU4 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ZMYND8Q9ULU4 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ZMYND8Q9ULU4 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ZMYND8Q9ULU4 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ZMYND8Q9ULU4 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ZMYND8Q9ULU4 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
ZMYND8Q9ULU4 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ZMYND8Q9ULU4 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ZMYND8Q9ULU4 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ZMYND8Q9ULU4 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ZMYND8Q9ULU4 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ZMYND8Q9ULU4 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ZMYND8Q9ULU4 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
ZMYND8Q9ULU4 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
ZMYND8Q9ULU4 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ZMYND8Q9ULU4 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ZMYND8Q9ULU4 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ZMYND8Q9ULU4 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ZMYND8Q9ULU4 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ZMYND8Q9ULU4 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms