Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULE3

DENND2A, DENN domain-containing protein 2A, humanhuman

Predictions only

Length 1,009 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DENND2AQ9ULE3 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
DENND2AQ9ULE3 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
DENND2AQ9ULE3 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
DENND2AQ9ULE3 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
DENND2AQ9ULE3 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
DENND2AQ9ULE3 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
DENND2AQ9ULE3 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
DENND2AQ9ULE3 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
DENND2AQ9ULE3 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
DENND2AQ9ULE3 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
DENND2AQ9ULE3 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
DENND2AQ9ULE3 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
DENND2AQ9ULE3 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
DENND2AQ9ULE3 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
DENND2AQ9ULE3 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
DENND2AQ9ULE3 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
DENND2AQ9ULE3 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
DENND2AQ9ULE3 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
DENND2AQ9ULE3 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
DENND2AQ9ULE3 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
DENND2AQ9ULE3 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DENND2AQ9ULE3 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DENND2AQ9ULE3 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
DENND2AQ9ULE3 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DENND2AQ9ULE3 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DENND2AQ9ULE3 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DENND2AQ9ULE3 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DENND2AQ9ULE3 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DENND2AQ9ULE3 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DENND2AQ9ULE3 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DENND2AQ9ULE3 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DENND2AQ9ULE3 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DENND2AQ9ULE3 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DENND2AQ9ULE3 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DENND2AQ9ULE3 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DENND2AQ9ULE3 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DENND2AQ9ULE3 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DENND2AQ9ULE3 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DENND2AQ9ULE3 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DENND2AQ9ULE3 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DENND2AQ9ULE3 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DENND2AQ9ULE3 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DENND2AQ9ULE3 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DENND2AQ9ULE3 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DENND2AQ9ULE3 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DENND2AQ9ULE3 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DENND2AQ9ULE3 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DENND2AQ9ULE3 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DENND2AQ9ULE3 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DENND2AQ9ULE3 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DENND2AQ9ULE3 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DENND2AQ9ULE3 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DENND2AQ9ULE3 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DENND2AQ9ULE3 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DENND2AQ9ULE3 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
DENND2AQ9ULE3 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DENND2AQ9ULE3 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DENND2AQ9ULE3 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DENND2AQ9ULE3 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DENND2AQ9ULE3 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DENND2AQ9ULE3 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DENND2AQ9ULE3 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DENND2AQ9ULE3 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DENND2AQ9ULE3 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DENND2AQ9ULE3 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DENND2AQ9ULE3 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
DENND2AQ9ULE3 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DENND2AQ9ULE3 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DENND2AQ9ULE3 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DENND2AQ9ULE3 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DENND2AQ9ULE3 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
DENND2AQ9ULE3 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
DENND2AQ9ULE3 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
DENND2AQ9ULE3 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
DENND2AQ9ULE3 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
DENND2AQ9ULE3 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DENND2AQ9ULE3 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DENND2AQ9ULE3 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DENND2AQ9ULE3 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
DENND2AQ9ULE3 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
DENND2AQ9ULE3 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
DENND2AQ9ULE3 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
DENND2AQ9ULE3 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
DENND2AQ9ULE3 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DENND2AQ9ULE3 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DENND2AQ9ULE3 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
DENND2AQ9ULE3 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
DENND2AQ9ULE3 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DENND2AQ9ULE3 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DENND2AQ9ULE3 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
DENND2AQ9ULE3 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
DENND2AQ9ULE3 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
DENND2AQ9ULE3 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
DENND2AQ9ULE3 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DENND2AQ9ULE3 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
DENND2AQ9ULE3 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
DENND2AQ9ULE3 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
DENND2AQ9ULE3 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
DENND2AQ9ULE3 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
DENND2AQ9ULE3 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms