Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULD4

BRPF3, Bromodomain and PHD finger-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRPF3Q9ULD4 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
BRPF3Q9ULD4 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
BRPF3Q9ULD4 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
BRPF3Q9ULD4 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
BRPF3Q9ULD4 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
BRPF3Q9ULD4 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
BRPF3Q9ULD4 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
BRPF3Q9ULD4 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
BRPF3Q9ULD4 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BRPF3Q9ULD4 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BRPF3Q9ULD4 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BRPF3Q9ULD4 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BRPF3Q9ULD4 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BRPF3Q9ULD4 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BRPF3Q9ULD4 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
BRPF3Q9ULD4 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BRPF3Q9ULD4 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
BRPF3Q9ULD4 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BRPF3Q9ULD4 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
BRPF3Q9ULD4 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BRPF3Q9ULD4 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
BRPF3Q9ULD4 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
BRPF3Q9ULD4 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
BRPF3Q9ULD4 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BRPF3Q9ULD4 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BRPF3Q9ULD4 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
BRPF3Q9ULD4 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BRPF3Q9ULD4 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BRPF3Q9ULD4 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
BRPF3Q9ULD4 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BRPF3Q9ULD4 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
BRPF3Q9ULD4 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
BRPF3Q9ULD4 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BRPF3Q9ULD4 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
BRPF3Q9ULD4 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BRPF3Q9ULD4 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BRPF3Q9ULD4 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BRPF3Q9ULD4 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
BRPF3Q9ULD4 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
BRPF3Q9ULD4 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
BRPF3Q9ULD4 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
BRPF3Q9ULD4 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
BRPF3Q9ULD4 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
BRPF3Q9ULD4 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
BRPF3Q9ULD4 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
BRPF3Q9ULD4 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
BRPF3Q9ULD4 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
BRPF3Q9ULD4 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
BRPF3Q9ULD4 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
BRPF3Q9ULD4 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
BRPF3Q9ULD4 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
BRPF3Q9ULD4 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
BRPF3Q9ULD4 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
BRPF3Q9ULD4 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
BRPF3Q9ULD4 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
BRPF3Q9ULD4 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
BRPF3Q9ULD4 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
BRPF3Q9ULD4 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
BRPF3Q9ULD4 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
BRPF3Q9ULD4 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
BRPF3Q9ULD4 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
BRPF3Q9ULD4 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
BRPF3Q9ULD4 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
BRPF3Q9ULD4 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
BRPF3Q9ULD4 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
BRPF3Q9ULD4 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
BRPF3Q9ULD4 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
BRPF3Q9ULD4 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
BRPF3Q9ULD4 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
BRPF3Q9ULD4 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
BRPF3Q9ULD4 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
BRPF3Q9ULD4 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
BRPF3Q9ULD4 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
BRPF3Q9ULD4 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
BRPF3Q9ULD4 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
BRPF3Q9ULD4 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
BRPF3Q9ULD4 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
BRPF3Q9ULD4 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
BRPF3Q9ULD4 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
BRPF3Q9ULD4 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
BRPF3Q9ULD4 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
BRPF3Q9ULD4 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
BRPF3Q9ULD4 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
BRPF3Q9ULD4 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
BRPF3Q9ULD4 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
BRPF3Q9ULD4 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
BRPF3Q9ULD4 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
BRPF3Q9ULD4 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
BRPF3Q9ULD4 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
BRPF3Q9ULD4 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
BRPF3Q9ULD4 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
BRPF3Q9ULD4 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
BRPF3Q9ULD4 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
BRPF3Q9ULD4 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
BRPF3Q9ULD4 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
BRPF3Q9ULD4 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
BRPF3Q9ULD4 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
BRPF3Q9ULD4 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
BRPF3Q9ULD4 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
BRPF3Q9ULD4 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms