Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKS6

PACSIN3, Protein kinase C and casein kinase substrate in neurons protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN3Q9UKS6 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PACSIN3Q9UKS6 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PACSIN3Q9UKS6 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PACSIN3Q9UKS6 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PACSIN3Q9UKS6 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PACSIN3Q9UKS6 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PACSIN3Q9UKS6 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PACSIN3Q9UKS6 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PACSIN3Q9UKS6 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PACSIN3Q9UKS6 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PACSIN3Q9UKS6 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PACSIN3Q9UKS6 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
PACSIN3Q9UKS6 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PACSIN3Q9UKS6 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PACSIN3Q9UKS6 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PACSIN3Q9UKS6 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PACSIN3Q9UKS6 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PACSIN3Q9UKS6 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
PACSIN3Q9UKS6 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PACSIN3Q9UKS6 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PACSIN3Q9UKS6 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PACSIN3Q9UKS6 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PACSIN3Q9UKS6 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PACSIN3Q9UKS6 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PACSIN3Q9UKS6 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PACSIN3Q9UKS6 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PACSIN3Q9UKS6 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PACSIN3Q9UKS6 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PACSIN3Q9UKS6 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PACSIN3Q9UKS6 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
PACSIN3Q9UKS6 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PACSIN3Q9UKS6 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
PACSIN3Q9UKS6 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PACSIN3Q9UKS6 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PACSIN3Q9UKS6 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PACSIN3Q9UKS6 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
PACSIN3Q9UKS6 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PACSIN3Q9UKS6 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PACSIN3Q9UKS6 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PACSIN3Q9UKS6 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PACSIN3Q9UKS6 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PACSIN3Q9UKS6 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PACSIN3Q9UKS6 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PACSIN3Q9UKS6 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PACSIN3Q9UKS6 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PACSIN3Q9UKS6 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PACSIN3Q9UKS6 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
PACSIN3Q9UKS6 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PACSIN3Q9UKS6 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PACSIN3Q9UKS6 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PACSIN3Q9UKS6 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PACSIN3Q9UKS6 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PACSIN3Q9UKS6 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PACSIN3Q9UKS6 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PACSIN3Q9UKS6 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PACSIN3Q9UKS6 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PACSIN3Q9UKS6 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PACSIN3Q9UKS6 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PACSIN3Q9UKS6 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PACSIN3Q9UKS6 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PACSIN3Q9UKS6 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PACSIN3Q9UKS6 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PACSIN3Q9UKS6 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PACSIN3Q9UKS6 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PACSIN3Q9UKS6 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PACSIN3Q9UKS6 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PACSIN3Q9UKS6 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PACSIN3Q9UKS6 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PACSIN3Q9UKS6 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PACSIN3Q9UKS6 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PACSIN3Q9UKS6 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
PACSIN3Q9UKS6 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PACSIN3Q9UKS6 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PACSIN3Q9UKS6 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PACSIN3Q9UKS6 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PACSIN3Q9UKS6 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PACSIN3Q9UKS6 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
PACSIN3Q9UKS6 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PACSIN3Q9UKS6 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PACSIN3Q9UKS6 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PACSIN3Q9UKS6 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
PACSIN3Q9UKS6 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PACSIN3Q9UKS6 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PACSIN3Q9UKS6 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PACSIN3Q9UKS6 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PACSIN3Q9UKS6 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PACSIN3Q9UKS6 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PACSIN3Q9UKS6 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PACSIN3Q9UKS6 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PACSIN3Q9UKS6 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PACSIN3Q9UKS6 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PACSIN3Q9UKS6 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PACSIN3Q9UKS6 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
PACSIN3Q9UKS6 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PACSIN3Q9UKS6 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PACSIN3Q9UKS6 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PACSIN3Q9UKS6 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PACSIN3Q9UKS6 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PACSIN3Q9UKS6 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PACSIN3Q9UKS6 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.3 ms