Protein–RNA interactions for Protein: Q9UK80

USP21, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 21, humanhuman

Predictions only

Length 565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP21Q9UK80 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
USP21Q9UK80 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
USP21Q9UK80 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
USP21Q9UK80 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
USP21Q9UK80 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
USP21Q9UK80 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
USP21Q9UK80 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
USP21Q9UK80 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
USP21Q9UK80 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
USP21Q9UK80 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
USP21Q9UK80 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
USP21Q9UK80 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
USP21Q9UK80 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
USP21Q9UK80 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
USP21Q9UK80 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
USP21Q9UK80 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
USP21Q9UK80 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
USP21Q9UK80 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
USP21Q9UK80 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
USP21Q9UK80 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
USP21Q9UK80 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
USP21Q9UK80 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
USP21Q9UK80 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
USP21Q9UK80 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
USP21Q9UK80 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
USP21Q9UK80 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
USP21Q9UK80 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
USP21Q9UK80 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
USP21Q9UK80 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
USP21Q9UK80 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
USP21Q9UK80 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
USP21Q9UK80 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
USP21Q9UK80 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
USP21Q9UK80 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
USP21Q9UK80 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
USP21Q9UK80 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
USP21Q9UK80 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
USP21Q9UK80 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
USP21Q9UK80 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
USP21Q9UK80 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
USP21Q9UK80 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
USP21Q9UK80 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
USP21Q9UK80 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
USP21Q9UK80 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
USP21Q9UK80 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
USP21Q9UK80 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
USP21Q9UK80 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
USP21Q9UK80 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
USP21Q9UK80 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
USP21Q9UK80 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
USP21Q9UK80 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
USP21Q9UK80 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
USP21Q9UK80 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
USP21Q9UK80 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
USP21Q9UK80 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
USP21Q9UK80 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
USP21Q9UK80 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
USP21Q9UK80 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
USP21Q9UK80 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
USP21Q9UK80 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
USP21Q9UK80 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
USP21Q9UK80 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
USP21Q9UK80 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
USP21Q9UK80 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
USP21Q9UK80 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
USP21Q9UK80 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
USP21Q9UK80 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
USP21Q9UK80 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
USP21Q9UK80 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
USP21Q9UK80 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
USP21Q9UK80 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
USP21Q9UK80 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
USP21Q9UK80 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
USP21Q9UK80 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
USP21Q9UK80 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
USP21Q9UK80 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
USP21Q9UK80 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC23.98■■□□□ 1.43
USP21Q9UK80 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
USP21Q9UK80 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
USP21Q9UK80 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
USP21Q9UK80 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
USP21Q9UK80 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
USP21Q9UK80 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
USP21Q9UK80 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
USP21Q9UK80 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
USP21Q9UK80 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
USP21Q9UK80 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
USP21Q9UK80 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
USP21Q9UK80 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
USP21Q9UK80 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
USP21Q9UK80 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
USP21Q9UK80 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
USP21Q9UK80 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
USP21Q9UK80 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
USP21Q9UK80 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
USP21Q9UK80 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
USP21Q9UK80 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
USP21Q9UK80 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
USP21Q9UK80 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
USP21Q9UK80 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.9 ms