Protein–RNA interactions for Protein: Q9UII2

ATPIF1, ATPase inhibitor, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 106 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATPIF1Q9UII2 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATPIF1Q9UII2 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATPIF1Q9UII2 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATPIF1Q9UII2 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATPIF1Q9UII2 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATPIF1Q9UII2 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATPIF1Q9UII2 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATPIF1Q9UII2 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATPIF1Q9UII2 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATPIF1Q9UII2 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATPIF1Q9UII2 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATPIF1Q9UII2 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATPIF1Q9UII2 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATPIF1Q9UII2 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATPIF1Q9UII2 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATPIF1Q9UII2 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATPIF1Q9UII2 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
ATPIF1Q9UII2 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATPIF1Q9UII2 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATPIF1Q9UII2 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATPIF1Q9UII2 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATPIF1Q9UII2 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATPIF1Q9UII2 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATPIF1Q9UII2 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATPIF1Q9UII2 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATPIF1Q9UII2 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
ATPIF1Q9UII2 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATPIF1Q9UII2 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATPIF1Q9UII2 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATPIF1Q9UII2 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATPIF1Q9UII2 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
ATPIF1Q9UII2 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
ATPIF1Q9UII2 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
ATPIF1Q9UII2 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATPIF1Q9UII2 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATPIF1Q9UII2 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
ATPIF1Q9UII2 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
ATPIF1Q9UII2 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATPIF1Q9UII2 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATPIF1Q9UII2 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATPIF1Q9UII2 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATPIF1Q9UII2 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATPIF1Q9UII2 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATPIF1Q9UII2 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATPIF1Q9UII2 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATPIF1Q9UII2 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATPIF1Q9UII2 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATPIF1Q9UII2 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATPIF1Q9UII2 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATPIF1Q9UII2 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATPIF1Q9UII2 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATPIF1Q9UII2 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATPIF1Q9UII2 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATPIF1Q9UII2 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATPIF1Q9UII2 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATPIF1Q9UII2 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATPIF1Q9UII2 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATPIF1Q9UII2 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATPIF1Q9UII2 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATPIF1Q9UII2 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATPIF1Q9UII2 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATPIF1Q9UII2 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATPIF1Q9UII2 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATPIF1Q9UII2 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATPIF1Q9UII2 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATPIF1Q9UII2 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATPIF1Q9UII2 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATPIF1Q9UII2 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATPIF1Q9UII2 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATPIF1Q9UII2 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATPIF1Q9UII2 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATPIF1Q9UII2 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
ATPIF1Q9UII2 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATPIF1Q9UII2 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATPIF1Q9UII2 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATPIF1Q9UII2 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATPIF1Q9UII2 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATPIF1Q9UII2 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATPIF1Q9UII2 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATPIF1Q9UII2 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATPIF1Q9UII2 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATPIF1Q9UII2 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATPIF1Q9UII2 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATPIF1Q9UII2 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATPIF1Q9UII2 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATPIF1Q9UII2 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATPIF1Q9UII2 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATPIF1Q9UII2 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATPIF1Q9UII2 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.18
ATPIF1Q9UII2 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
ATPIF1Q9UII2 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
ATPIF1Q9UII2 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
ATPIF1Q9UII2 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
ATPIF1Q9UII2 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATPIF1Q9UII2 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATPIF1Q9UII2 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATPIF1Q9UII2 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATPIF1Q9UII2 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATPIF1Q9UII2 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATPIF1Q9UII2 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms