Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHD9

UBQLN2, Ubiquilin-2, humanhuman

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Length 624 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBQLN2Q9UHD9 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBQLN2Q9UHD9 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBQLN2Q9UHD9 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBQLN2Q9UHD9 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBQLN2Q9UHD9 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBQLN2Q9UHD9 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBQLN2Q9UHD9 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBQLN2Q9UHD9 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBQLN2Q9UHD9 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBQLN2Q9UHD9 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBQLN2Q9UHD9 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBQLN2Q9UHD9 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
UBQLN2Q9UHD9 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBQLN2Q9UHD9 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBQLN2Q9UHD9 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBQLN2Q9UHD9 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBQLN2Q9UHD9 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBQLN2Q9UHD9 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
UBQLN2Q9UHD9 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBQLN2Q9UHD9 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
UBQLN2Q9UHD9 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBQLN2Q9UHD9 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBQLN2Q9UHD9 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
UBQLN2Q9UHD9 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBQLN2Q9UHD9 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBQLN2Q9UHD9 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBQLN2Q9UHD9 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBQLN2Q9UHD9 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
UBQLN2Q9UHD9 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
UBQLN2Q9UHD9 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
UBQLN2Q9UHD9 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
UBQLN2Q9UHD9 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
UBQLN2Q9UHD9 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
UBQLN2Q9UHD9 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
UBQLN2Q9UHD9 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
UBQLN2Q9UHD9 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
UBQLN2Q9UHD9 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
UBQLN2Q9UHD9 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
UBQLN2Q9UHD9 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBQLN2Q9UHD9 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBQLN2Q9UHD9 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBQLN2Q9UHD9 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBQLN2Q9UHD9 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBQLN2Q9UHD9 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBQLN2Q9UHD9 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBQLN2Q9UHD9 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBQLN2Q9UHD9 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBQLN2Q9UHD9 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBQLN2Q9UHD9 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBQLN2Q9UHD9 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBQLN2Q9UHD9 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
UBQLN2Q9UHD9 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBQLN2Q9UHD9 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBQLN2Q9UHD9 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBQLN2Q9UHD9 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBQLN2Q9UHD9 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBQLN2Q9UHD9 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
UBQLN2Q9UHD9 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBQLN2Q9UHD9 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBQLN2Q9UHD9 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
UBQLN2Q9UHD9 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBQLN2Q9UHD9 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBQLN2Q9UHD9 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBQLN2Q9UHD9 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBQLN2Q9UHD9 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBQLN2Q9UHD9 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBQLN2Q9UHD9 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBQLN2Q9UHD9 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBQLN2Q9UHD9 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
UBQLN2Q9UHD9 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBQLN2Q9UHD9 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBQLN2Q9UHD9 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBQLN2Q9UHD9 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBQLN2Q9UHD9 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBQLN2Q9UHD9 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBQLN2Q9UHD9 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBQLN2Q9UHD9 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBQLN2Q9UHD9 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBQLN2Q9UHD9 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBQLN2Q9UHD9 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBQLN2Q9UHD9 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBQLN2Q9UHD9 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBQLN2Q9UHD9 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBQLN2Q9UHD9 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBQLN2Q9UHD9 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBQLN2Q9UHD9 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBQLN2Q9UHD9 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBQLN2Q9UHD9 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBQLN2Q9UHD9 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBQLN2Q9UHD9 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBQLN2Q9UHD9 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBQLN2Q9UHD9 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBQLN2Q9UHD9 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBQLN2Q9UHD9 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBQLN2Q9UHD9 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBQLN2Q9UHD9 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBQLN2Q9UHD9 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBQLN2Q9UHD9 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBQLN2Q9UHD9 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBQLN2Q9UHD9 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
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