Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHC1

MLH3, DNA mismatch repair protein Mlh3, humanhuman

Predictions only

Length 1,453 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MLH3Q9UHC1 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
MLH3Q9UHC1 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
MLH3Q9UHC1 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
MLH3Q9UHC1 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
MLH3Q9UHC1 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
MLH3Q9UHC1 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
MLH3Q9UHC1 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
MLH3Q9UHC1 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
MLH3Q9UHC1 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
MLH3Q9UHC1 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
MLH3Q9UHC1 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
MLH3Q9UHC1 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
MLH3Q9UHC1 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
MLH3Q9UHC1 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
MLH3Q9UHC1 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
MLH3Q9UHC1 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
MLH3Q9UHC1 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
MLH3Q9UHC1 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
MLH3Q9UHC1 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
MLH3Q9UHC1 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
MLH3Q9UHC1 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
MLH3Q9UHC1 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
MLH3Q9UHC1 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
MLH3Q9UHC1 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
MLH3Q9UHC1 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
MLH3Q9UHC1 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
MLH3Q9UHC1 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
MLH3Q9UHC1 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
MLH3Q9UHC1 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
MLH3Q9UHC1 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
MLH3Q9UHC1 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
MLH3Q9UHC1 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
MLH3Q9UHC1 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
MLH3Q9UHC1 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
MLH3Q9UHC1 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
MLH3Q9UHC1 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
MLH3Q9UHC1 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
MLH3Q9UHC1 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
MLH3Q9UHC1 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
MLH3Q9UHC1 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
MLH3Q9UHC1 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
MLH3Q9UHC1 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
MLH3Q9UHC1 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
MLH3Q9UHC1 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
MLH3Q9UHC1 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
MLH3Q9UHC1 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
MLH3Q9UHC1 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
MLH3Q9UHC1 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.91
MLH3Q9UHC1 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
MLH3Q9UHC1 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.91
MLH3Q9UHC1 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
MLH3Q9UHC1 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
MLH3Q9UHC1 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
MLH3Q9UHC1 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
MLH3Q9UHC1 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
MLH3Q9UHC1 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
MLH3Q9UHC1 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
MLH3Q9UHC1 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
MLH3Q9UHC1 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
MLH3Q9UHC1 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
MLH3Q9UHC1 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
MLH3Q9UHC1 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
MLH3Q9UHC1 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
MLH3Q9UHC1 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC26.94■■□□□ 1.9
MLH3Q9UHC1 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
MLH3Q9UHC1 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
MLH3Q9UHC1 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
MLH3Q9UHC1 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
MLH3Q9UHC1 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
MLH3Q9UHC1 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
MLH3Q9UHC1 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
MLH3Q9UHC1 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
MLH3Q9UHC1 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
MLH3Q9UHC1 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
MLH3Q9UHC1 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
MLH3Q9UHC1 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
MLH3Q9UHC1 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
MLH3Q9UHC1 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
MLH3Q9UHC1 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
MLH3Q9UHC1 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
MLH3Q9UHC1 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC26.93■■□□□ 1.9
MLH3Q9UHC1 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
MLH3Q9UHC1 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
MLH3Q9UHC1 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
MLH3Q9UHC1 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
MLH3Q9UHC1 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
MLH3Q9UHC1 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
MLH3Q9UHC1 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
MLH3Q9UHC1 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
MLH3Q9UHC1 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
MLH3Q9UHC1 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
MLH3Q9UHC1 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
MLH3Q9UHC1 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
MLH3Q9UHC1 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
MLH3Q9UHC1 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
MLH3Q9UHC1 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
MLH3Q9UHC1 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
MLH3Q9UHC1 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
MLH3Q9UHC1 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
MLH3Q9UHC1 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms