Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2M1

LRP2BP, LRP2-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP2BPQ9P2M1 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
LRP2BPQ9P2M1 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC22■■□□□ 1.11
LRP2BPQ9P2M1 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
LRP2BPQ9P2M1 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LRP2BPQ9P2M1 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LRP2BPQ9P2M1 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LRP2BPQ9P2M1 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
LRP2BPQ9P2M1 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LRP2BPQ9P2M1 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LRP2BPQ9P2M1 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LRP2BPQ9P2M1 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LRP2BPQ9P2M1 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LRP2BPQ9P2M1 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LRP2BPQ9P2M1 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
LRP2BPQ9P2M1 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LRP2BPQ9P2M1 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LRP2BPQ9P2M1 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LRP2BPQ9P2M1 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LRP2BPQ9P2M1 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LRP2BPQ9P2M1 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LRP2BPQ9P2M1 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LRP2BPQ9P2M1 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LRP2BPQ9P2M1 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LRP2BPQ9P2M1 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
LRP2BPQ9P2M1 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LRP2BPQ9P2M1 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
LRP2BPQ9P2M1 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LRP2BPQ9P2M1 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LRP2BPQ9P2M1 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LRP2BPQ9P2M1 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
LRP2BPQ9P2M1 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
LRP2BPQ9P2M1 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
LRP2BPQ9P2M1 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
LRP2BPQ9P2M1 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LRP2BPQ9P2M1 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LRP2BPQ9P2M1 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LRP2BPQ9P2M1 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LRP2BPQ9P2M1 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LRP2BPQ9P2M1 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LRP2BPQ9P2M1 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LRP2BPQ9P2M1 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LRP2BPQ9P2M1 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
LRP2BPQ9P2M1 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LRP2BPQ9P2M1 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LRP2BPQ9P2M1 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LRP2BPQ9P2M1 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LRP2BPQ9P2M1 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LRP2BPQ9P2M1 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LRP2BPQ9P2M1 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LRP2BPQ9P2M1 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LRP2BPQ9P2M1 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LRP2BPQ9P2M1 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
LRP2BPQ9P2M1 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LRP2BPQ9P2M1 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
LRP2BPQ9P2M1 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LRP2BPQ9P2M1 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LRP2BPQ9P2M1 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LRP2BPQ9P2M1 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LRP2BPQ9P2M1 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LRP2BPQ9P2M1 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LRP2BPQ9P2M1 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LRP2BPQ9P2M1 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LRP2BPQ9P2M1 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LRP2BPQ9P2M1 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LRP2BPQ9P2M1 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LRP2BPQ9P2M1 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LRP2BPQ9P2M1 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LRP2BPQ9P2M1 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LRP2BPQ9P2M1 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LRP2BPQ9P2M1 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LRP2BPQ9P2M1 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LRP2BPQ9P2M1 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LRP2BPQ9P2M1 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
LRP2BPQ9P2M1 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LRP2BPQ9P2M1 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LRP2BPQ9P2M1 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LRP2BPQ9P2M1 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LRP2BPQ9P2M1 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LRP2BPQ9P2M1 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LRP2BPQ9P2M1 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LRP2BPQ9P2M1 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LRP2BPQ9P2M1 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LRP2BPQ9P2M1 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
LRP2BPQ9P2M1 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LRP2BPQ9P2M1 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LRP2BPQ9P2M1 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LRP2BPQ9P2M1 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LRP2BPQ9P2M1 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LRP2BPQ9P2M1 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LRP2BPQ9P2M1 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LRP2BPQ9P2M1 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LRP2BPQ9P2M1 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LRP2BPQ9P2M1 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LRP2BPQ9P2M1 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
LRP2BPQ9P2M1 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
LRP2BPQ9P2M1 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LRP2BPQ9P2M1 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LRP2BPQ9P2M1 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LRP2BPQ9P2M1 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LRP2BPQ9P2M1 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms