Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E5

CHPF2, Chondroitin sulfate glucuronyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 772 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHPF2Q9P2E5 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CHPF2Q9P2E5 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
CHPF2Q9P2E5 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CHPF2Q9P2E5 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
CHPF2Q9P2E5 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
CHPF2Q9P2E5 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CHPF2Q9P2E5 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
CHPF2Q9P2E5 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
CHPF2Q9P2E5 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CHPF2Q9P2E5 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CHPF2Q9P2E5 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CHPF2Q9P2E5 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CHPF2Q9P2E5 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CHPF2Q9P2E5 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CHPF2Q9P2E5 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CHPF2Q9P2E5 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CHPF2Q9P2E5 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CHPF2Q9P2E5 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
CHPF2Q9P2E5 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CHPF2Q9P2E5 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CHPF2Q9P2E5 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CHPF2Q9P2E5 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CHPF2Q9P2E5 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CHPF2Q9P2E5 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CHPF2Q9P2E5 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CHPF2Q9P2E5 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CHPF2Q9P2E5 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CHPF2Q9P2E5 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CHPF2Q9P2E5 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
CHPF2Q9P2E5 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CHPF2Q9P2E5 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CHPF2Q9P2E5 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CHPF2Q9P2E5 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CHPF2Q9P2E5 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
CHPF2Q9P2E5 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
CHPF2Q9P2E5 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CHPF2Q9P2E5 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CHPF2Q9P2E5 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CHPF2Q9P2E5 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CHPF2Q9P2E5 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CHPF2Q9P2E5 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CHPF2Q9P2E5 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CHPF2Q9P2E5 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CHPF2Q9P2E5 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CHPF2Q9P2E5 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CHPF2Q9P2E5 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CHPF2Q9P2E5 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CHPF2Q9P2E5 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CHPF2Q9P2E5 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CHPF2Q9P2E5 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CHPF2Q9P2E5 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CHPF2Q9P2E5 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CHPF2Q9P2E5 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CHPF2Q9P2E5 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
CHPF2Q9P2E5 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CHPF2Q9P2E5 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CHPF2Q9P2E5 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CHPF2Q9P2E5 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CHPF2Q9P2E5 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CHPF2Q9P2E5 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CHPF2Q9P2E5 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CHPF2Q9P2E5 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CHPF2Q9P2E5 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CHPF2Q9P2E5 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CHPF2Q9P2E5 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CHPF2Q9P2E5 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CHPF2Q9P2E5 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CHPF2Q9P2E5 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CHPF2Q9P2E5 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CHPF2Q9P2E5 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CHPF2Q9P2E5 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CHPF2Q9P2E5 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
CHPF2Q9P2E5 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CHPF2Q9P2E5 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CHPF2Q9P2E5 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CHPF2Q9P2E5 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CHPF2Q9P2E5 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CHPF2Q9P2E5 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CHPF2Q9P2E5 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CHPF2Q9P2E5 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CHPF2Q9P2E5 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CHPF2Q9P2E5 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CHPF2Q9P2E5 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CHPF2Q9P2E5 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CHPF2Q9P2E5 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CHPF2Q9P2E5 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CHPF2Q9P2E5 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CHPF2Q9P2E5 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CHPF2Q9P2E5 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CHPF2Q9P2E5 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CHPF2Q9P2E5 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CHPF2Q9P2E5 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CHPF2Q9P2E5 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CHPF2Q9P2E5 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
CHPF2Q9P2E5 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
CHPF2Q9P2E5 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CHPF2Q9P2E5 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CHPF2Q9P2E5 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CHPF2Q9P2E5 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CHPF2Q9P2E5 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms