Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0J7

KCMF1, E3 ubiquitin-protein ligase KCMF1, humanhuman

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCMF1Q9P0J7 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
KCMF1Q9P0J7 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
KCMF1Q9P0J7 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
KCMF1Q9P0J7 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
KCMF1Q9P0J7 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
KCMF1Q9P0J7 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
KCMF1Q9P0J7 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
KCMF1Q9P0J7 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
KCMF1Q9P0J7 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
KCMF1Q9P0J7 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
KCMF1Q9P0J7 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
KCMF1Q9P0J7 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
KCMF1Q9P0J7 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
KCMF1Q9P0J7 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
KCMF1Q9P0J7 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
KCMF1Q9P0J7 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
KCMF1Q9P0J7 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
KCMF1Q9P0J7 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
KCMF1Q9P0J7 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
KCMF1Q9P0J7 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
KCMF1Q9P0J7 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
KCMF1Q9P0J7 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
KCMF1Q9P0J7 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
KCMF1Q9P0J7 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
KCMF1Q9P0J7 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
KCMF1Q9P0J7 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
KCMF1Q9P0J7 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
KCMF1Q9P0J7 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
KCMF1Q9P0J7 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
KCMF1Q9P0J7 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
KCMF1Q9P0J7 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
KCMF1Q9P0J7 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
KCMF1Q9P0J7 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
KCMF1Q9P0J7 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
KCMF1Q9P0J7 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
KCMF1Q9P0J7 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
KCMF1Q9P0J7 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
KCMF1Q9P0J7 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
KCMF1Q9P0J7 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
KCMF1Q9P0J7 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
KCMF1Q9P0J7 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
KCMF1Q9P0J7 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
KCMF1Q9P0J7 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
KCMF1Q9P0J7 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
KCMF1Q9P0J7 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
KCMF1Q9P0J7 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
KCMF1Q9P0J7 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
KCMF1Q9P0J7 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
KCMF1Q9P0J7 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
KCMF1Q9P0J7 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
KCMF1Q9P0J7 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
KCMF1Q9P0J7 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
KCMF1Q9P0J7 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
KCMF1Q9P0J7 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
KCMF1Q9P0J7 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
KCMF1Q9P0J7 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
KCMF1Q9P0J7 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
KCMF1Q9P0J7 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
KCMF1Q9P0J7 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
KCMF1Q9P0J7 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
KCMF1Q9P0J7 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
KCMF1Q9P0J7 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
KCMF1Q9P0J7 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
KCMF1Q9P0J7 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
KCMF1Q9P0J7 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
KCMF1Q9P0J7 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
KCMF1Q9P0J7 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
KCMF1Q9P0J7 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
KCMF1Q9P0J7 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
KCMF1Q9P0J7 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
KCMF1Q9P0J7 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
KCMF1Q9P0J7 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
KCMF1Q9P0J7 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
KCMF1Q9P0J7 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
KCMF1Q9P0J7 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
KCMF1Q9P0J7 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
KCMF1Q9P0J7 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
KCMF1Q9P0J7 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
KCMF1Q9P0J7 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
KCMF1Q9P0J7 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
KCMF1Q9P0J7 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
KCMF1Q9P0J7 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
KCMF1Q9P0J7 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
KCMF1Q9P0J7 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
KCMF1Q9P0J7 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
KCMF1Q9P0J7 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
KCMF1Q9P0J7 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
KCMF1Q9P0J7 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
KCMF1Q9P0J7 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
KCMF1Q9P0J7 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
KCMF1Q9P0J7 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
KCMF1Q9P0J7 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
KCMF1Q9P0J7 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
KCMF1Q9P0J7 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
KCMF1Q9P0J7 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
KCMF1Q9P0J7 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
KCMF1Q9P0J7 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
KCMF1Q9P0J7 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
KCMF1Q9P0J7 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
KCMF1Q9P0J7 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms