Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZN3

EHD3, EH domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHD3Q9NZN3 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
EHD3Q9NZN3 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
EHD3Q9NZN3 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
EHD3Q9NZN3 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
EHD3Q9NZN3 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
EHD3Q9NZN3 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
EHD3Q9NZN3 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
EHD3Q9NZN3 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
EHD3Q9NZN3 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
EHD3Q9NZN3 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
EHD3Q9NZN3 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
EHD3Q9NZN3 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
EHD3Q9NZN3 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
EHD3Q9NZN3 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
EHD3Q9NZN3 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
EHD3Q9NZN3 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
EHD3Q9NZN3 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
EHD3Q9NZN3 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
EHD3Q9NZN3 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
EHD3Q9NZN3 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
EHD3Q9NZN3 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
EHD3Q9NZN3 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
EHD3Q9NZN3 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
EHD3Q9NZN3 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
EHD3Q9NZN3 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
EHD3Q9NZN3 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
EHD3Q9NZN3 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
EHD3Q9NZN3 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
EHD3Q9NZN3 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
EHD3Q9NZN3 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
EHD3Q9NZN3 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.38
EHD3Q9NZN3 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
EHD3Q9NZN3 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
EHD3Q9NZN3 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
EHD3Q9NZN3 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
EHD3Q9NZN3 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
EHD3Q9NZN3 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
EHD3Q9NZN3 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
EHD3Q9NZN3 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
EHD3Q9NZN3 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
EHD3Q9NZN3 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
EHD3Q9NZN3 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
EHD3Q9NZN3 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
EHD3Q9NZN3 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
EHD3Q9NZN3 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
EHD3Q9NZN3 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
EHD3Q9NZN3 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
EHD3Q9NZN3 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
EHD3Q9NZN3 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
EHD3Q9NZN3 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC17.45■□□□□ 0.38
EHD3Q9NZN3 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
EHD3Q9NZN3 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
EHD3Q9NZN3 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
EHD3Q9NZN3 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
EHD3Q9NZN3 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
EHD3Q9NZN3 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
EHD3Q9NZN3 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
EHD3Q9NZN3 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
EHD3Q9NZN3 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
EHD3Q9NZN3 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
EHD3Q9NZN3 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
EHD3Q9NZN3 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
EHD3Q9NZN3 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
EHD3Q9NZN3 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
EHD3Q9NZN3 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
EHD3Q9NZN3 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
EHD3Q9NZN3 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
EHD3Q9NZN3 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
EHD3Q9NZN3 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
EHD3Q9NZN3 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
EHD3Q9NZN3 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
EHD3Q9NZN3 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
EHD3Q9NZN3 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
EHD3Q9NZN3 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
EHD3Q9NZN3 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
EHD3Q9NZN3 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
EHD3Q9NZN3 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
EHD3Q9NZN3 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
EHD3Q9NZN3 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
EHD3Q9NZN3 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
EHD3Q9NZN3 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
EHD3Q9NZN3 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
EHD3Q9NZN3 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
EHD3Q9NZN3 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
EHD3Q9NZN3 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
EHD3Q9NZN3 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
EHD3Q9NZN3 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
EHD3Q9NZN3 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
EHD3Q9NZN3 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
EHD3Q9NZN3 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
EHD3Q9NZN3 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
EHD3Q9NZN3 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
EHD3Q9NZN3 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
EHD3Q9NZN3 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
EHD3Q9NZN3 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
EHD3Q9NZN3 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
EHD3Q9NZN3 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
EHD3Q9NZN3 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
EHD3Q9NZN3 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
EHD3Q9NZN3 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms