Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYZ1

TVP23B, Golgi apparatus membrane protein TVP23 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TVP23BQ9NYZ1 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TVP23BQ9NYZ1 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TVP23BQ9NYZ1 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TVP23BQ9NYZ1 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TVP23BQ9NYZ1 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TVP23BQ9NYZ1 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TVP23BQ9NYZ1 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TVP23BQ9NYZ1 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TVP23BQ9NYZ1 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TVP23BQ9NYZ1 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TVP23BQ9NYZ1 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TVP23BQ9NYZ1 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TVP23BQ9NYZ1 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TVP23BQ9NYZ1 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TVP23BQ9NYZ1 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TVP23BQ9NYZ1 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TVP23BQ9NYZ1 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TVP23BQ9NYZ1 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
TVP23BQ9NYZ1 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TVP23BQ9NYZ1 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TVP23BQ9NYZ1 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TVP23BQ9NYZ1 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TVP23BQ9NYZ1 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TVP23BQ9NYZ1 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TVP23BQ9NYZ1 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TVP23BQ9NYZ1 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TVP23BQ9NYZ1 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TVP23BQ9NYZ1 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TVP23BQ9NYZ1 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TVP23BQ9NYZ1 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TVP23BQ9NYZ1 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TVP23BQ9NYZ1 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TVP23BQ9NYZ1 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TVP23BQ9NYZ1 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TVP23BQ9NYZ1 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
TVP23BQ9NYZ1 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TVP23BQ9NYZ1 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TVP23BQ9NYZ1 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TVP23BQ9NYZ1 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TVP23BQ9NYZ1 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TVP23BQ9NYZ1 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TVP23BQ9NYZ1 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TVP23BQ9NYZ1 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TVP23BQ9NYZ1 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TVP23BQ9NYZ1 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TVP23BQ9NYZ1 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TVP23BQ9NYZ1 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TVP23BQ9NYZ1 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TVP23BQ9NYZ1 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TVP23BQ9NYZ1 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TVP23BQ9NYZ1 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TVP23BQ9NYZ1 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TVP23BQ9NYZ1 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TVP23BQ9NYZ1 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
TVP23BQ9NYZ1 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TVP23BQ9NYZ1 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
TVP23BQ9NYZ1 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
TVP23BQ9NYZ1 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TVP23BQ9NYZ1 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TVP23BQ9NYZ1 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TVP23BQ9NYZ1 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TVP23BQ9NYZ1 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TVP23BQ9NYZ1 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TVP23BQ9NYZ1 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TVP23BQ9NYZ1 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TVP23BQ9NYZ1 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TVP23BQ9NYZ1 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TVP23BQ9NYZ1 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
TVP23BQ9NYZ1 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TVP23BQ9NYZ1 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TVP23BQ9NYZ1 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TVP23BQ9NYZ1 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TVP23BQ9NYZ1 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TVP23BQ9NYZ1 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TVP23BQ9NYZ1 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
TVP23BQ9NYZ1 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TVP23BQ9NYZ1 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TVP23BQ9NYZ1 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TVP23BQ9NYZ1 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TVP23BQ9NYZ1 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TVP23BQ9NYZ1 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TVP23BQ9NYZ1 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TVP23BQ9NYZ1 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TVP23BQ9NYZ1 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TVP23BQ9NYZ1 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
TVP23BQ9NYZ1 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TVP23BQ9NYZ1 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
TVP23BQ9NYZ1 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
TVP23BQ9NYZ1 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TVP23BQ9NYZ1 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TVP23BQ9NYZ1 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TVP23BQ9NYZ1 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TVP23BQ9NYZ1 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TVP23BQ9NYZ1 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TVP23BQ9NYZ1 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TVP23BQ9NYZ1 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TVP23BQ9NYZ1 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TVP23BQ9NYZ1 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TVP23BQ9NYZ1 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TVP23BQ9NYZ1 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms