Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS15

LTBP3, Latent-transforming growth factor beta-binding protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,303 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBP3Q9NS15 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
LTBP3Q9NS15 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
LTBP3Q9NS15 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
LTBP3Q9NS15 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
LTBP3Q9NS15 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.1
LTBP3Q9NS15 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
LTBP3Q9NS15 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
LTBP3Q9NS15 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
LTBP3Q9NS15 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
LTBP3Q9NS15 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
LTBP3Q9NS15 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
LTBP3Q9NS15 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
LTBP3Q9NS15 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
LTBP3Q9NS15 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
LTBP3Q9NS15 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
LTBP3Q9NS15 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
LTBP3Q9NS15 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LTBP3Q9NS15 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
LTBP3Q9NS15 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LTBP3Q9NS15 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LTBP3Q9NS15 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
LTBP3Q9NS15 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC21.88■■□□□ 1.09
LTBP3Q9NS15 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
LTBP3Q9NS15 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
LTBP3Q9NS15 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
LTBP3Q9NS15 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
LTBP3Q9NS15 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
LTBP3Q9NS15 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
LTBP3Q9NS15 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
LTBP3Q9NS15 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
LTBP3Q9NS15 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LTBP3Q9NS15 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
LTBP3Q9NS15 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LTBP3Q9NS15 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
LTBP3Q9NS15 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
LTBP3Q9NS15 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
LTBP3Q9NS15 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LTBP3Q9NS15 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LTBP3Q9NS15 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LTBP3Q9NS15 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LTBP3Q9NS15 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LTBP3Q9NS15 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
LTBP3Q9NS15 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
LTBP3Q9NS15 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LTBP3Q9NS15 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LTBP3Q9NS15 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LTBP3Q9NS15 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LTBP3Q9NS15 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LTBP3Q9NS15 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
LTBP3Q9NS15 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LTBP3Q9NS15 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LTBP3Q9NS15 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LTBP3Q9NS15 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LTBP3Q9NS15 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LTBP3Q9NS15 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LTBP3Q9NS15 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LTBP3Q9NS15 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LTBP3Q9NS15 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LTBP3Q9NS15 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
LTBP3Q9NS15 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LTBP3Q9NS15 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LTBP3Q9NS15 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LTBP3Q9NS15 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LTBP3Q9NS15 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LTBP3Q9NS15 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LTBP3Q9NS15 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
LTBP3Q9NS15 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LTBP3Q9NS15 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
LTBP3Q9NS15 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LTBP3Q9NS15 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LTBP3Q9NS15 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
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LTBP3Q9NS15 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LTBP3Q9NS15 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LTBP3Q9NS15 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LTBP3Q9NS15 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LTBP3Q9NS15 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LTBP3Q9NS15 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LTBP3Q9NS15 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LTBP3Q9NS15 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LTBP3Q9NS15 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LTBP3Q9NS15 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LTBP3Q9NS15 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LTBP3Q9NS15 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LTBP3Q9NS15 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LTBP3Q9NS15 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LTBP3Q9NS15 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LTBP3Q9NS15 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LTBP3Q9NS15 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LTBP3Q9NS15 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LTBP3Q9NS15 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LTBP3Q9NS15 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LTBP3Q9NS15 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LTBP3Q9NS15 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LTBP3Q9NS15 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
LTBP3Q9NS15 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LTBP3Q9NS15 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
LTBP3Q9NS15 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LTBP3Q9NS15 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LTBP3Q9NS15 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
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