Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQS7

INCENP, Inner centromere protein, humanhuman

Predictions only

Length 918 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
INCENPQ9NQS7 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
INCENPQ9NQS7 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
INCENPQ9NQS7 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
INCENPQ9NQS7 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
INCENPQ9NQS7 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
INCENPQ9NQS7 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
INCENPQ9NQS7 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
INCENPQ9NQS7 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
INCENPQ9NQS7 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
INCENPQ9NQS7 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
INCENPQ9NQS7 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
INCENPQ9NQS7 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
INCENPQ9NQS7 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
INCENPQ9NQS7 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
INCENPQ9NQS7 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
INCENPQ9NQS7 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
INCENPQ9NQS7 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
INCENPQ9NQS7 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
INCENPQ9NQS7 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
INCENPQ9NQS7 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
INCENPQ9NQS7 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
INCENPQ9NQS7 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
INCENPQ9NQS7 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
INCENPQ9NQS7 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
INCENPQ9NQS7 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
INCENPQ9NQS7 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
INCENPQ9NQS7 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
INCENPQ9NQS7 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
INCENPQ9NQS7 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
INCENPQ9NQS7 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
INCENPQ9NQS7 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
INCENPQ9NQS7 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
INCENPQ9NQS7 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
INCENPQ9NQS7 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
INCENPQ9NQS7 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
INCENPQ9NQS7 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
INCENPQ9NQS7 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
INCENPQ9NQS7 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
INCENPQ9NQS7 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
INCENPQ9NQS7 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
INCENPQ9NQS7 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
INCENPQ9NQS7 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
INCENPQ9NQS7 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
INCENPQ9NQS7 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
INCENPQ9NQS7 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
INCENPQ9NQS7 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
INCENPQ9NQS7 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
INCENPQ9NQS7 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
INCENPQ9NQS7 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
INCENPQ9NQS7 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
INCENPQ9NQS7 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
INCENPQ9NQS7 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
INCENPQ9NQS7 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
INCENPQ9NQS7 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
INCENPQ9NQS7 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
INCENPQ9NQS7 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
INCENPQ9NQS7 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
INCENPQ9NQS7 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
INCENPQ9NQS7 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
INCENPQ9NQS7 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
INCENPQ9NQS7 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
INCENPQ9NQS7 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
INCENPQ9NQS7 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
INCENPQ9NQS7 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
INCENPQ9NQS7 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
INCENPQ9NQS7 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
INCENPQ9NQS7 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
INCENPQ9NQS7 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
INCENPQ9NQS7 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
INCENPQ9NQS7 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
INCENPQ9NQS7 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
INCENPQ9NQS7 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
INCENPQ9NQS7 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
INCENPQ9NQS7 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
INCENPQ9NQS7 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
INCENPQ9NQS7 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
INCENPQ9NQS7 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
INCENPQ9NQS7 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
INCENPQ9NQS7 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
INCENPQ9NQS7 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
INCENPQ9NQS7 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
INCENPQ9NQS7 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
INCENPQ9NQS7 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
INCENPQ9NQS7 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
INCENPQ9NQS7 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
INCENPQ9NQS7 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
INCENPQ9NQS7 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
INCENPQ9NQS7 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
INCENPQ9NQS7 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
INCENPQ9NQS7 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
INCENPQ9NQS7 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
INCENPQ9NQS7 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
INCENPQ9NQS7 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
INCENPQ9NQS7 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
INCENPQ9NQS7 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
INCENPQ9NQS7 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
INCENPQ9NQS7 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
INCENPQ9NQS7 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
INCENPQ9NQS7 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
INCENPQ9NQS7 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms