Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ75

CASS4, Cas scaffolding protein family member 4, humanhuman

Predictions only

Length 786 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASS4Q9NQ75 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CASS4Q9NQ75 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CASS4Q9NQ75 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CASS4Q9NQ75 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CASS4Q9NQ75 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CASS4Q9NQ75 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CASS4Q9NQ75 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CASS4Q9NQ75 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CASS4Q9NQ75 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CASS4Q9NQ75 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CASS4Q9NQ75 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CASS4Q9NQ75 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CASS4Q9NQ75 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CASS4Q9NQ75 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CASS4Q9NQ75 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CASS4Q9NQ75 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CASS4Q9NQ75 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CASS4Q9NQ75 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CASS4Q9NQ75 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CASS4Q9NQ75 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CASS4Q9NQ75 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CASS4Q9NQ75 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CASS4Q9NQ75 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CASS4Q9NQ75 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CASS4Q9NQ75 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CASS4Q9NQ75 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CASS4Q9NQ75 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CASS4Q9NQ75 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CASS4Q9NQ75 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CASS4Q9NQ75 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CASS4Q9NQ75 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CASS4Q9NQ75 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
CASS4Q9NQ75 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CASS4Q9NQ75 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CASS4Q9NQ75 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CASS4Q9NQ75 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CASS4Q9NQ75 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
CASS4Q9NQ75 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CASS4Q9NQ75 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CASS4Q9NQ75 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CASS4Q9NQ75 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CASS4Q9NQ75 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CASS4Q9NQ75 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
CASS4Q9NQ75 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CASS4Q9NQ75 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CASS4Q9NQ75 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
CASS4Q9NQ75 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CASS4Q9NQ75 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CASS4Q9NQ75 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CASS4Q9NQ75 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CASS4Q9NQ75 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CASS4Q9NQ75 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CASS4Q9NQ75 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CASS4Q9NQ75 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CASS4Q9NQ75 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CASS4Q9NQ75 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CASS4Q9NQ75 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CASS4Q9NQ75 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CASS4Q9NQ75 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CASS4Q9NQ75 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CASS4Q9NQ75 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CASS4Q9NQ75 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CASS4Q9NQ75 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CASS4Q9NQ75 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CASS4Q9NQ75 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CASS4Q9NQ75 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CASS4Q9NQ75 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CASS4Q9NQ75 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CASS4Q9NQ75 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CASS4Q9NQ75 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CASS4Q9NQ75 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CASS4Q9NQ75 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CASS4Q9NQ75 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CASS4Q9NQ75 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CASS4Q9NQ75 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CASS4Q9NQ75 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CASS4Q9NQ75 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CASS4Q9NQ75 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CASS4Q9NQ75 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CASS4Q9NQ75 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CASS4Q9NQ75 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CASS4Q9NQ75 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CASS4Q9NQ75 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CASS4Q9NQ75 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CASS4Q9NQ75 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CASS4Q9NQ75 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CASS4Q9NQ75 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CASS4Q9NQ75 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CASS4Q9NQ75 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CASS4Q9NQ75 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CASS4Q9NQ75 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CASS4Q9NQ75 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CASS4Q9NQ75 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CASS4Q9NQ75 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CASS4Q9NQ75 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CASS4Q9NQ75 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CASS4Q9NQ75 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CASS4Q9NQ75 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CASS4Q9NQ75 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CASS4Q9NQ75 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms