Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC97

GPR35, G-protein coupled receptor 35, humanhuman

Predictions only

Length 309 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPR35Q9HC97 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GPR35Q9HC97 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GPR35Q9HC97 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GPR35Q9HC97 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GPR35Q9HC97 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GPR35Q9HC97 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GPR35Q9HC97 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GPR35Q9HC97 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GPR35Q9HC97 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GPR35Q9HC97 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GPR35Q9HC97 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GPR35Q9HC97 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GPR35Q9HC97 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GPR35Q9HC97 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GPR35Q9HC97 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GPR35Q9HC97 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GPR35Q9HC97 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GPR35Q9HC97 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
GPR35Q9HC97 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GPR35Q9HC97 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GPR35Q9HC97 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GPR35Q9HC97 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GPR35Q9HC97 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GPR35Q9HC97 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GPR35Q9HC97 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GPR35Q9HC97 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GPR35Q9HC97 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GPR35Q9HC97 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GPR35Q9HC97 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GPR35Q9HC97 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
GPR35Q9HC97 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
GPR35Q9HC97 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GPR35Q9HC97 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GPR35Q9HC97 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GPR35Q9HC97 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
GPR35Q9HC97 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GPR35Q9HC97 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GPR35Q9HC97 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GPR35Q9HC97 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GPR35Q9HC97 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GPR35Q9HC97 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GPR35Q9HC97 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GPR35Q9HC97 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GPR35Q9HC97 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
GPR35Q9HC97 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
GPR35Q9HC97 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
GPR35Q9HC97 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
GPR35Q9HC97 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.17
GPR35Q9HC97 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
GPR35Q9HC97 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GPR35Q9HC97 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GPR35Q9HC97 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GPR35Q9HC97 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GPR35Q9HC97 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GPR35Q9HC97 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GPR35Q9HC97 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GPR35Q9HC97 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GPR35Q9HC97 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GPR35Q9HC97 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GPR35Q9HC97 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GPR35Q9HC97 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GPR35Q9HC97 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GPR35Q9HC97 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GPR35Q9HC97 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GPR35Q9HC97 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GPR35Q9HC97 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GPR35Q9HC97 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GPR35Q9HC97 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GPR35Q9HC97 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GPR35Q9HC97 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GPR35Q9HC97 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GPR35Q9HC97 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GPR35Q9HC97 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GPR35Q9HC97 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GPR35Q9HC97 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GPR35Q9HC97 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GPR35Q9HC97 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
GPR35Q9HC97 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GPR35Q9HC97 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GPR35Q9HC97 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GPR35Q9HC97 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GPR35Q9HC97 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GPR35Q9HC97 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GPR35Q9HC97 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GPR35Q9HC97 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GPR35Q9HC97 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GPR35Q9HC97 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GPR35Q9HC97 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GPR35Q9HC97 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GPR35Q9HC97 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GPR35Q9HC97 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
GPR35Q9HC97 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GPR35Q9HC97 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GPR35Q9HC97 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GPR35Q9HC97 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GPR35Q9HC97 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GPR35Q9HC97 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GPR35Q9HC97 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GPR35Q9HC97 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GPR35Q9HC97 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms