Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZP0

PDGFD, Platelet-derived growth factor D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDGFDQ9GZP0 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PDGFDQ9GZP0 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
PDGFDQ9GZP0 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PDGFDQ9GZP0 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
PDGFDQ9GZP0 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PDGFDQ9GZP0 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
PDGFDQ9GZP0 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PDGFDQ9GZP0 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PDGFDQ9GZP0 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PDGFDQ9GZP0 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PDGFDQ9GZP0 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PDGFDQ9GZP0 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
PDGFDQ9GZP0 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PDGFDQ9GZP0 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
PDGFDQ9GZP0 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PDGFDQ9GZP0 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PDGFDQ9GZP0 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PDGFDQ9GZP0 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PDGFDQ9GZP0 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
PDGFDQ9GZP0 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PDGFDQ9GZP0 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
PDGFDQ9GZP0 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
PDGFDQ9GZP0 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PDGFDQ9GZP0 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
PDGFDQ9GZP0 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PDGFDQ9GZP0 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PDGFDQ9GZP0 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PDGFDQ9GZP0 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PDGFDQ9GZP0 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PDGFDQ9GZP0 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PDGFDQ9GZP0 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PDGFDQ9GZP0 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PDGFDQ9GZP0 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PDGFDQ9GZP0 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PDGFDQ9GZP0 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
PDGFDQ9GZP0 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PDGFDQ9GZP0 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PDGFDQ9GZP0 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PDGFDQ9GZP0 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PDGFDQ9GZP0 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PDGFDQ9GZP0 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PDGFDQ9GZP0 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PDGFDQ9GZP0 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PDGFDQ9GZP0 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PDGFDQ9GZP0 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PDGFDQ9GZP0 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PDGFDQ9GZP0 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PDGFDQ9GZP0 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PDGFDQ9GZP0 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PDGFDQ9GZP0 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PDGFDQ9GZP0 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PDGFDQ9GZP0 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PDGFDQ9GZP0 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PDGFDQ9GZP0 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
PDGFDQ9GZP0 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PDGFDQ9GZP0 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
PDGFDQ9GZP0 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
PDGFDQ9GZP0 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PDGFDQ9GZP0 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PDGFDQ9GZP0 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PDGFDQ9GZP0 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PDGFDQ9GZP0 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PDGFDQ9GZP0 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
PDGFDQ9GZP0 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PDGFDQ9GZP0 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PDGFDQ9GZP0 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PDGFDQ9GZP0 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PDGFDQ9GZP0 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PDGFDQ9GZP0 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PDGFDQ9GZP0 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
PDGFDQ9GZP0 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PDGFDQ9GZP0 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PDGFDQ9GZP0 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDGFDQ9GZP0 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDGFDQ9GZP0 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDGFDQ9GZP0 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDGFDQ9GZP0 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDGFDQ9GZP0 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDGFDQ9GZP0 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDGFDQ9GZP0 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDGFDQ9GZP0 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDGFDQ9GZP0 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDGFDQ9GZP0 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDGFDQ9GZP0 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDGFDQ9GZP0 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDGFDQ9GZP0 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDGFDQ9GZP0 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDGFDQ9GZP0 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDGFDQ9GZP0 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
PDGFDQ9GZP0 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
PDGFDQ9GZP0 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDGFDQ9GZP0 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDGFDQ9GZP0 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDGFDQ9GZP0 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDGFDQ9GZP0 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDGFDQ9GZP0 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDGFDQ9GZP0 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDGFDQ9GZP0 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDGFDQ9GZP0 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDGFDQ9GZP0 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms