Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0D3

ZYG11B, Protein zyg-11 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 744 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZYG11BQ9C0D3 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ZYG11BQ9C0D3 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ZYG11BQ9C0D3 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ZYG11BQ9C0D3 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ZYG11BQ9C0D3 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZYG11BQ9C0D3 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZYG11BQ9C0D3 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZYG11BQ9C0D3 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZYG11BQ9C0D3 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZYG11BQ9C0D3 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZYG11BQ9C0D3 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZYG11BQ9C0D3 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZYG11BQ9C0D3 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZYG11BQ9C0D3 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZYG11BQ9C0D3 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZYG11BQ9C0D3 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZYG11BQ9C0D3 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZYG11BQ9C0D3 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZYG11BQ9C0D3 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
ZYG11BQ9C0D3 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZYG11BQ9C0D3 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
ZYG11BQ9C0D3 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZYG11BQ9C0D3 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
ZYG11BQ9C0D3 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZYG11BQ9C0D3 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZYG11BQ9C0D3 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZYG11BQ9C0D3 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZYG11BQ9C0D3 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZYG11BQ9C0D3 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZYG11BQ9C0D3 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZYG11BQ9C0D3 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
ZYG11BQ9C0D3 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
ZYG11BQ9C0D3 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZYG11BQ9C0D3 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZYG11BQ9C0D3 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZYG11BQ9C0D3 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZYG11BQ9C0D3 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZYG11BQ9C0D3 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZYG11BQ9C0D3 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZYG11BQ9C0D3 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
ZYG11BQ9C0D3 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZYG11BQ9C0D3 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZYG11BQ9C0D3 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZYG11BQ9C0D3 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZYG11BQ9C0D3 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZYG11BQ9C0D3 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZYG11BQ9C0D3 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZYG11BQ9C0D3 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZYG11BQ9C0D3 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZYG11BQ9C0D3 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZYG11BQ9C0D3 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZYG11BQ9C0D3 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZYG11BQ9C0D3 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZYG11BQ9C0D3 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZYG11BQ9C0D3 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZYG11BQ9C0D3 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZYG11BQ9C0D3 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZYG11BQ9C0D3 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
ZYG11BQ9C0D3 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZYG11BQ9C0D3 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
ZYG11BQ9C0D3 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
ZYG11BQ9C0D3 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
ZYG11BQ9C0D3 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
ZYG11BQ9C0D3 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZYG11BQ9C0D3 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZYG11BQ9C0D3 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZYG11BQ9C0D3 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZYG11BQ9C0D3 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZYG11BQ9C0D3 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
ZYG11BQ9C0D3 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZYG11BQ9C0D3 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZYG11BQ9C0D3 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZYG11BQ9C0D3 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZYG11BQ9C0D3 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
ZYG11BQ9C0D3 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZYG11BQ9C0D3 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZYG11BQ9C0D3 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZYG11BQ9C0D3 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZYG11BQ9C0D3 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZYG11BQ9C0D3 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZYG11BQ9C0D3 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZYG11BQ9C0D3 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ZYG11BQ9C0D3 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ZYG11BQ9C0D3 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ZYG11BQ9C0D3 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ZYG11BQ9C0D3 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ZYG11BQ9C0D3 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ZYG11BQ9C0D3 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ZYG11BQ9C0D3 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
ZYG11BQ9C0D3 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ZYG11BQ9C0D3 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ZYG11BQ9C0D3 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ZYG11BQ9C0D3 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ZYG11BQ9C0D3 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ZYG11BQ9C0D3 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ZYG11BQ9C0D3 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ZYG11BQ9C0D3 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ZYG11BQ9C0D3 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ZYG11BQ9C0D3 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ZYG11BQ9C0D3 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms