Protein–RNA interactions for Protein: Q9C075

KRT23, Keratin, type I cytoskeletal 23, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT23Q9C075 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
KRT23Q9C075 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
KRT23Q9C075 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
KRT23Q9C075 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
KRT23Q9C075 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
KRT23Q9C075 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
KRT23Q9C075 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
KRT23Q9C075 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
KRT23Q9C075 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
KRT23Q9C075 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
KRT23Q9C075 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
KRT23Q9C075 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
KRT23Q9C075 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
KRT23Q9C075 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
KRT23Q9C075 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
KRT23Q9C075 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
KRT23Q9C075 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
KRT23Q9C075 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
KRT23Q9C075 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
KRT23Q9C075 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
KRT23Q9C075 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
KRT23Q9C075 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
KRT23Q9C075 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
KRT23Q9C075 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
KRT23Q9C075 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
KRT23Q9C075 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
KRT23Q9C075 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
KRT23Q9C075 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
KRT23Q9C075 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
KRT23Q9C075 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
KRT23Q9C075 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
KRT23Q9C075 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
KRT23Q9C075 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
KRT23Q9C075 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
KRT23Q9C075 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
KRT23Q9C075 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
KRT23Q9C075 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
KRT23Q9C075 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
KRT23Q9C075 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
KRT23Q9C075 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
KRT23Q9C075 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
KRT23Q9C075 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
KRT23Q9C075 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
KRT23Q9C075 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
KRT23Q9C075 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
KRT23Q9C075 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
KRT23Q9C075 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
KRT23Q9C075 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
KRT23Q9C075 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
KRT23Q9C075 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
KRT23Q9C075 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
KRT23Q9C075 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
KRT23Q9C075 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
KRT23Q9C075 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
KRT23Q9C075 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
KRT23Q9C075 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
KRT23Q9C075 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
KRT23Q9C075 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
KRT23Q9C075 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
KRT23Q9C075 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
KRT23Q9C075 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
KRT23Q9C075 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
KRT23Q9C075 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
KRT23Q9C075 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
KRT23Q9C075 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
KRT23Q9C075 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
KRT23Q9C075 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
KRT23Q9C075 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
KRT23Q9C075 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KRT23Q9C075 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
KRT23Q9C075 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KRT23Q9C075 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
KRT23Q9C075 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
KRT23Q9C075 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
KRT23Q9C075 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
KRT23Q9C075 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KRT23Q9C075 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
KRT23Q9C075 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
KRT23Q9C075 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
KRT23Q9C075 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KRT23Q9C075 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
KRT23Q9C075 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KRT23Q9C075 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
KRT23Q9C075 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KRT23Q9C075 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KRT23Q9C075 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KRT23Q9C075 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
KRT23Q9C075 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KRT23Q9C075 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
KRT23Q9C075 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
KRT23Q9C075 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
KRT23Q9C075 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
KRT23Q9C075 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
KRT23Q9C075 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
KRT23Q9C075 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
KRT23Q9C075 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
KRT23Q9C075 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
KRT23Q9C075 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
KRT23Q9C075 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
KRT23Q9C075 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.3 ms