Protein–RNA interactions for Protein: Q9C009

FOXQ1, Forkhead box protein Q1, humanhuman

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Length 403 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXQ1Q9C009 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC18.36■□□□□ 0.53
FOXQ1Q9C009 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
FOXQ1Q9C009 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
FOXQ1Q9C009 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
FOXQ1Q9C009 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC18.36■□□□□ 0.53
FOXQ1Q9C009 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
FOXQ1Q9C009 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
FOXQ1Q9C009 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
FOXQ1Q9C009 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
FOXQ1Q9C009 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
FOXQ1Q9C009 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
FOXQ1Q9C009 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
FOXQ1Q9C009 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
FOXQ1Q9C009 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
FOXQ1Q9C009 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
FOXQ1Q9C009 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
FOXQ1Q9C009 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
FOXQ1Q9C009 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
FOXQ1Q9C009 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
FOXQ1Q9C009 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
FOXQ1Q9C009 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
FOXQ1Q9C009 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
FOXQ1Q9C009 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
FOXQ1Q9C009 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
FOXQ1Q9C009 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
FOXQ1Q9C009 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
FOXQ1Q9C009 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
FOXQ1Q9C009 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
FOXQ1Q9C009 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
FOXQ1Q9C009 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
FOXQ1Q9C009 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
FOXQ1Q9C009 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
FOXQ1Q9C009 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
FOXQ1Q9C009 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.35■□□□□ 0.53
FOXQ1Q9C009 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
FOXQ1Q9C009 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
FOXQ1Q9C009 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
FOXQ1Q9C009 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
FOXQ1Q9C009 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
FOXQ1Q9C009 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
FOXQ1Q9C009 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
FOXQ1Q9C009 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
FOXQ1Q9C009 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
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FOXQ1Q9C009 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
FOXQ1Q9C009 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
FOXQ1Q9C009 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
FOXQ1Q9C009 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
FOXQ1Q9C009 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
FOXQ1Q9C009 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
FOXQ1Q9C009 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
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FOXQ1Q9C009 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
FOXQ1Q9C009 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
FOXQ1Q9C009 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
FOXQ1Q9C009 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
FOXQ1Q9C009 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
FOXQ1Q9C009 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
FOXQ1Q9C009 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
FOXQ1Q9C009 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
FOXQ1Q9C009 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
FOXQ1Q9C009 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
FOXQ1Q9C009 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
FOXQ1Q9C009 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
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FOXQ1Q9C009 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC18.34■□□□□ 0.53
FOXQ1Q9C009 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
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FOXQ1Q9C009 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
FOXQ1Q9C009 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
FOXQ1Q9C009 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
FOXQ1Q9C009 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
FOXQ1Q9C009 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
FOXQ1Q9C009 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
FOXQ1Q9C009 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
FOXQ1Q9C009 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
FOXQ1Q9C009 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
FOXQ1Q9C009 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
FOXQ1Q9C009 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
FOXQ1Q9C009 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
FOXQ1Q9C009 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
FOXQ1Q9C009 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
FOXQ1Q9C009 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
FOXQ1Q9C009 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
FOXQ1Q9C009 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
FOXQ1Q9C009 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
FOXQ1Q9C009 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
FOXQ1Q9C009 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
FOXQ1Q9C009 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
FOXQ1Q9C009 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
FOXQ1Q9C009 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
FOXQ1Q9C009 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
FOXQ1Q9C009 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
FOXQ1Q9C009 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
FOXQ1Q9C009 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
FOXQ1Q9C009 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
FOXQ1Q9C009 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
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