Protein–RNA interactions for Protein: Q9C000

NLRP1, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP1Q9C000 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
NLRP1Q9C000 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
NLRP1Q9C000 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
NLRP1Q9C000 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
NLRP1Q9C000 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
NLRP1Q9C000 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
NLRP1Q9C000 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
NLRP1Q9C000 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
NLRP1Q9C000 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
NLRP1Q9C000 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
NLRP1Q9C000 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
NLRP1Q9C000 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
NLRP1Q9C000 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
NLRP1Q9C000 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
NLRP1Q9C000 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
NLRP1Q9C000 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
NLRP1Q9C000 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
NLRP1Q9C000 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
NLRP1Q9C000 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
NLRP1Q9C000 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
NLRP1Q9C000 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
NLRP1Q9C000 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC26.12■■□□□ 1.77
NLRP1Q9C000 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
NLRP1Q9C000 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
NLRP1Q9C000 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
NLRP1Q9C000 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
NLRP1Q9C000 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
NLRP1Q9C000 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
NLRP1Q9C000 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC26.11■■□□□ 1.77
NLRP1Q9C000 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
NLRP1Q9C000 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
NLRP1Q9C000 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
NLRP1Q9C000 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
NLRP1Q9C000 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NLRP1Q9C000 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
NLRP1Q9C000 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC26.11■■□□□ 1.77
NLRP1Q9C000 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
NLRP1Q9C000 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NLRP1Q9C000 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NLRP1Q9C000 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
NLRP1Q9C000 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NLRP1Q9C000 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
NLRP1Q9C000 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
NLRP1Q9C000 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NLRP1Q9C000 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NLRP1Q9C000 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
NLRP1Q9C000 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NLRP1Q9C000 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NLRP1Q9C000 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NLRP1Q9C000 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NLRP1Q9C000 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
NLRP1Q9C000 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
NLRP1Q9C000 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
NLRP1Q9C000 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
NLRP1Q9C000 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC26.11■■□□□ 1.77
NLRP1Q9C000 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NLRP1Q9C000 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NLRP1Q9C000 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NLRP1Q9C000 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
NLRP1Q9C000 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NLRP1Q9C000 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NLRP1Q9C000 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
NLRP1Q9C000 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NLRP1Q9C000 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
NLRP1Q9C000 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NLRP1Q9C000 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NLRP1Q9C000 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
NLRP1Q9C000 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
NLRP1Q9C000 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC26.1■■□□□ 1.77
NLRP1Q9C000 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
NLRP1Q9C000 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
NLRP1Q9C000 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC26.1■■□□□ 1.77
NLRP1Q9C000 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NLRP1Q9C000 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
NLRP1Q9C000 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
NLRP1Q9C000 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
NLRP1Q9C000 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NLRP1Q9C000 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NLRP1Q9C000 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
NLRP1Q9C000 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NLRP1Q9C000 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NLRP1Q9C000 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NLRP1Q9C000 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
NLRP1Q9C000 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC26.09■■□□□ 1.77
NLRP1Q9C000 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
NLRP1Q9C000 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
NLRP1Q9C000 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
NLRP1Q9C000 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
NLRP1Q9C000 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
NLRP1Q9C000 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
NLRP1Q9C000 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
NLRP1Q9C000 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
NLRP1Q9C000 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
NLRP1Q9C000 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
NLRP1Q9C000 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
NLRP1Q9C000 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
NLRP1Q9C000 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
NLRP1Q9C000 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
NLRP1Q9C000 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
NLRP1Q9C000 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms