Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY07

SLC4A5, Electrogenic sodium bicarbonate cotransporter 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A5Q9BY07 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SLC4A5Q9BY07 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SLC4A5Q9BY07 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SLC4A5Q9BY07 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SLC4A5Q9BY07 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SLC4A5Q9BY07 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SLC4A5Q9BY07 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SLC4A5Q9BY07 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SLC4A5Q9BY07 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SLC4A5Q9BY07 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SLC4A5Q9BY07 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SLC4A5Q9BY07 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SLC4A5Q9BY07 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
SLC4A5Q9BY07 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SLC4A5Q9BY07 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SLC4A5Q9BY07 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SLC4A5Q9BY07 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SLC4A5Q9BY07 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SLC4A5Q9BY07 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SLC4A5Q9BY07 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SLC4A5Q9BY07 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SLC4A5Q9BY07 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SLC4A5Q9BY07 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
SLC4A5Q9BY07 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SLC4A5Q9BY07 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SLC4A5Q9BY07 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SLC4A5Q9BY07 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
SLC4A5Q9BY07 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SLC4A5Q9BY07 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SLC4A5Q9BY07 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SLC4A5Q9BY07 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SLC4A5Q9BY07 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SLC4A5Q9BY07 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SLC4A5Q9BY07 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SLC4A5Q9BY07 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SLC4A5Q9BY07 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SLC4A5Q9BY07 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SLC4A5Q9BY07 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SLC4A5Q9BY07 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SLC4A5Q9BY07 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SLC4A5Q9BY07 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SLC4A5Q9BY07 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SLC4A5Q9BY07 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SLC4A5Q9BY07 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SLC4A5Q9BY07 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SLC4A5Q9BY07 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SLC4A5Q9BY07 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SLC4A5Q9BY07 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SLC4A5Q9BY07 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SLC4A5Q9BY07 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SLC4A5Q9BY07 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SLC4A5Q9BY07 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SLC4A5Q9BY07 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SLC4A5Q9BY07 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SLC4A5Q9BY07 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SLC4A5Q9BY07 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SLC4A5Q9BY07 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SLC4A5Q9BY07 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SLC4A5Q9BY07 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SLC4A5Q9BY07 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SLC4A5Q9BY07 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SLC4A5Q9BY07 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SLC4A5Q9BY07 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SLC4A5Q9BY07 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SLC4A5Q9BY07 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SLC4A5Q9BY07 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SLC4A5Q9BY07 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SLC4A5Q9BY07 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SLC4A5Q9BY07 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SLC4A5Q9BY07 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SLC4A5Q9BY07 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SLC4A5Q9BY07 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SLC4A5Q9BY07 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SLC4A5Q9BY07 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SLC4A5Q9BY07 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SLC4A5Q9BY07 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SLC4A5Q9BY07 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SLC4A5Q9BY07 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
SLC4A5Q9BY07 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
SLC4A5Q9BY07 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SLC4A5Q9BY07 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SLC4A5Q9BY07 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SLC4A5Q9BY07 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SLC4A5Q9BY07 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SLC4A5Q9BY07 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SLC4A5Q9BY07 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SLC4A5Q9BY07 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SLC4A5Q9BY07 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SLC4A5Q9BY07 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SLC4A5Q9BY07 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SLC4A5Q9BY07 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SLC4A5Q9BY07 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SLC4A5Q9BY07 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SLC4A5Q9BY07 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SLC4A5Q9BY07 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SLC4A5Q9BY07 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SLC4A5Q9BY07 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SLC4A5Q9BY07 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SLC4A5Q9BY07 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SLC4A5Q9BY07 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms