Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXW3

SNHG12, Putative uncharacterized protein SNHG12, humanhuman

Predictions only

Length 62 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNHG12Q9BXW3 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SNHG12Q9BXW3 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SNHG12Q9BXW3 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
SNHG12Q9BXW3 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SNHG12Q9BXW3 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SNHG12Q9BXW3 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SNHG12Q9BXW3 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SNHG12Q9BXW3 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SNHG12Q9BXW3 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SNHG12Q9BXW3 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SNHG12Q9BXW3 ELN-208ENST00000380575 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SNHG12Q9BXW3 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SNHG12Q9BXW3 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SNHG12Q9BXW3 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SNHG12Q9BXW3 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SNHG12Q9BXW3 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SNHG12Q9BXW3 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SNHG12Q9BXW3 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SNHG12Q9BXW3 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
SNHG12Q9BXW3 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
SNHG12Q9BXW3 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SNHG12Q9BXW3 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SNHG12Q9BXW3 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SNHG12Q9BXW3 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SNHG12Q9BXW3 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SNHG12Q9BXW3 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SNHG12Q9BXW3 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SNHG12Q9BXW3 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SNHG12Q9BXW3 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SNHG12Q9BXW3 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SNHG12Q9BXW3 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SNHG12Q9BXW3 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SNHG12Q9BXW3 RUBCNL-204ENST00000378797 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SNHG12Q9BXW3 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SNHG12Q9BXW3 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SNHG12Q9BXW3 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SNHG12Q9BXW3 OSGIN1-201ENST00000343939 2391 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SNHG12Q9BXW3 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SNHG12Q9BXW3 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SNHG12Q9BXW3 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SNHG12Q9BXW3 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SNHG12Q9BXW3 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
SNHG12Q9BXW3 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SNHG12Q9BXW3 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SNHG12Q9BXW3 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SNHG12Q9BXW3 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SNHG12Q9BXW3 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SNHG12Q9BXW3 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SNHG12Q9BXW3 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SNHG12Q9BXW3 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SNHG12Q9BXW3 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SNHG12Q9BXW3 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SNHG12Q9BXW3 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
SNHG12Q9BXW3 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SNHG12Q9BXW3 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SNHG12Q9BXW3 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SNHG12Q9BXW3 PEX5-207ENST00000455147 2689 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SNHG12Q9BXW3 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SNHG12Q9BXW3 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SNHG12Q9BXW3 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SNHG12Q9BXW3 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SNHG12Q9BXW3 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SNHG12Q9BXW3 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SNHG12Q9BXW3 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
SNHG12Q9BXW3 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SNHG12Q9BXW3 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SNHG12Q9BXW3 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SNHG12Q9BXW3 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SNHG12Q9BXW3 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SNHG12Q9BXW3 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
SNHG12Q9BXW3 TP53I11-201ENST00000308212 3683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SNHG12Q9BXW3 USP31-203ENST00000567975 2142 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SNHG12Q9BXW3 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SNHG12Q9BXW3 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SNHG12Q9BXW3 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SNHG12Q9BXW3 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SNHG12Q9BXW3 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SNHG12Q9BXW3 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SNHG12Q9BXW3 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SNHG12Q9BXW3 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SNHG12Q9BXW3 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
SNHG12Q9BXW3 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SNHG12Q9BXW3 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SNHG12Q9BXW3 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SNHG12Q9BXW3 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SNHG12Q9BXW3 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SNHG12Q9BXW3 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SNHG12Q9BXW3 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SNHG12Q9BXW3 AC079781.5-202ENST00000641784 3743 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
SNHG12Q9BXW3 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SNHG12Q9BXW3 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SNHG12Q9BXW3 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SNHG12Q9BXW3 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SNHG12Q9BXW3 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SNHG12Q9BXW3 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SNHG12Q9BXW3 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
SNHG12Q9BXW3 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SNHG12Q9BXW3 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SNHG12Q9BXW3 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SNHG12Q9BXW3 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms